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一個旨在幫助全球研究人員開發禽流感和季節性流感病毒疫苗（更不用說高產的 H1N1“豬流感”）的資料庫，現在正處於其共同建立者之間醜陋裂痕的中心。發起這項工作的全球共享禽流感資料倡議 (GISAID) 基金會和構建了實際流感基因序列“EpiFlu”資料庫的瑞士生物資訊學研究所 (SIB) 都聲稱擁有該專案的所有權，這要歸功於法律和財務糾葛，現在將由法院來理清。
目前，這場爭端導致了兩個 EpiFlu 資料庫的存在（一個由位於華盛頓特區的 GISAID 基金會於週一啟動，另一個由 SIB 管理），這種情況可能會破壞建立中央儲存庫以改進流感資料共享的目標。
GISAID 宣佈計劃在 2006 年 H5N1 禽流感爆發後建立原始 EpiFlu 資料庫，作為一種為研究人員提供快速訪問基因序列資料的方式。然後，該基金會與 SIB 簽訂合同，進行構建實際資料庫所需的程式設計。
自 2008 年 5 月上線以來，150 多個國家的科學家已將 GISAID EpiFlu 資料庫用作關於流感基因序列的免費公共資訊共享來源。然而，對於 GISAID 來說，麻煩出現在 7 月 27 日，當時 SIB 切斷了從 GISAID.org 網站訪問 EpiFlu 資料的許可權。SIB 引用“合同和法律問題”，將所有註冊使用者重定向到 SIB 網站以訪問資訊。
一位 GISAID 基金會董事會成員表示，“SIB 斷開了與我們入口網站的連線，並告訴研究人員直接連線到 SIB”，由於與 SIB 正在美國哥倫比亞特區地方法院進行的訴訟以及在瑞士日內瓦進行的仲裁程式，該成員要求不公開身份。
SIB 主任羅恩·阿佩爾在一份宣告中表示，GISAID 沒有全額支付其組織的工作費用，並且根據瑞士法律，拖欠付款會使合同無效，從而使 SIB 擁有其構建的資料庫的權利。
GISAID 基金會對這一說法提出異議，稱 SIB 的工作已由美國疾病控制與預防中心 (CDC) 和瑞士政府支付。據該基金會董事會成員稱，SIB“無權這樣做或自行運營 EpiFlu 資料庫”。
位於北卡羅來納州研究三角園的 Alphavax 和位於馬里蘭州羅克維爾的 Novavax, Inc. 等生物技術公司依賴 EpiFlu 資料庫中包含的資訊來幫助他們開發原型流感疫苗，而無需等待 CDC 釋出病毒參考毒株，這在疫情爆發後可能需要幾周時間。與更傳統的雞蛋基方法相比，他們的方法有望使他們能夠快速、大量地生產疫苗。
EpiFlu 模型類似於開源軟體模型，程式設計師可以使用網路上免費提供的程式碼片段來構建或改進他們的軟體。（開源專案成功的一個主要例子是 Linux 作業系統。）根據EpiFlu 訪問條款，所有使用者都同意免費共享自己的資料，在使用他人資料時給予適當的致謝，並協同工作。
GISAID 的新流感資料庫由 馬克斯·普朗克資訊學研究所計算生物學和應用演算法學部以及內容管理系統軟體製造商 a3 systems, GmbH 獨立於 SIB 和 WHO 開發。該資料庫包含近 30,000 個分離株（或病毒樣本）的資訊，包括原始資料庫（SIB 仍在管理）的內容，以及聯合國糧食及農業組織和世界動物衛生組織的獸醫參考實驗室向 GISAID 貢獻的新發現。
GISAID 資料庫最初的建立部分是為了解決發展中國家研究人員的投訴，他們說，以前由 WHO 執行的資料共享系統迫使他們在將病毒樣本傳送給 WHO 時放棄其病毒樣本的智慧財產權。然後，這些病毒樣本將被私人制藥公司用於製造疫苗，這些疫苗被授予專利並以許多貧困國家無法承受的價格出售，美聯社在 2008 年 10 月報道。
GISAID 資訊庫的另一個推動力來自 2006 年，當時義大利獸醫和研究員伊拉里亞·卡普阿透露，在禽流感案例中，WHO 將一些關鍵資訊儲存在新墨西哥州洛斯阿拉莫斯的一個私人資料庫中，僅供 15 個實驗室訪問，美聯社在 2008 年 5 月報道。