為了改進癌症護理,研究人員今天宣佈計劃建立一個巨型資料庫,旨在讓腫瘤學家和科學家共享重要資訊。新澤西州癌症研究所 (CINJ) 和羅格斯大學(均位於新不倫瑞克)以及 IBM 正在開發一個計算機系統,使全球的醫生和研究人員能夠利用癌症研究和治療的最新進展;他們將其設想為一種工具,幫助醫生為患者量身定製最佳療法,並讓科學家追蹤先前研究的成功或失敗。
特別是,該系統將包含一個癌組織微陣列的數字資料庫,可以用於比較新的樣本。這將使醫生和研究人員能夠研究如何治療類似的癌症以及哪種療法效果最好。
該專案的首席研究員,位於新澤西州皮斯卡塔韋市的 U.M.D.N.J–羅伯特伍德約翰遜醫學院生物醫學影像與資訊學中心主任、病理學和實驗室醫學教授 David Foran 說,這樣的資料庫將有助於醫生確定在發現惡性腫瘤後最佳的治療方法。
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組織微陣列允許研究人員一次測試許多活組織檢查的切片。“在識別疾病的哪個階段有哪些蛋白質發揮作用,以及是什麼導致疾病發生方面,它在研究和發現中具有極高的價值,”Foran 說。
新的決策支援系統將擴充套件 CINJ 的“幫助戰勝癌症”專案,該專案於 2006 年 7 月啟動,旨在開發用於改進組織樣本中癌症檢測的軟體和演算法。該專案的初始階段獲得了美國國立衛生研究院 (NIH) 250 萬美元的撥款,建立了一個大型資料庫,使醫生和研究人員能夠比較乳腺癌、結腸癌以及頭頸癌患者的各種治療方案。
正在開發的決策支援軟體將使該過程更進一步,允許醫生和科學家分析和分類標本的數字化組織微陣列影像,並將它們與系統中已有的 100,000 多個樣本進行對比。俄亥俄州立大學醫學中心將對該軟體進行修改,使其可以在研究人員可以訪問的計算機網格上執行。CINJ 及其合作伙伴計劃擴充套件該系統,以包含有關其他形式癌症的資訊,但尚未確定時間表。
Foran 和他的同事計劃透過在 CINJ 和俄亥俄州立大學 (O.S.U.) 使用映象站點,並在 NIH 的癌症生物醫學資訊學網格專案 (caBIG) 的支援下,與全國其他癌症研究機構共享這些技術。CINJ 和 O.S.U. 將最初使用網格技術向其機構以及亞利桑那州立大學和賓夕法尼亞大學醫學院的癌症研究人員提供對軟體和資料庫的訪問許可權。隨著專案的進展,訪問許可權將擴大。
在其初始階段,“幫助戰勝癌症”專案利用了 IBM 世界社群網格的計算能力來建立決策支援系統將訪問的表達模式資料庫。世界社群網格是一個虛擬超級計算機,其計算資源來自全球數千名志願者的捐贈,他們將其 PC 的一部分未使用的處理能力提供給該網格。IBM 全球社群倡議副總裁 Robin Willner 說,IBM 於 2004 年 11 月建立了世界社群網格,旨在為那些沒有其他方式推進的科學和研究專案提供計算資源。
除了這個研究專案之外,該網格還主辦了另外八個主要在生物醫學領域的專案,包括那些試圖開發治療 HIV/AIDS、登革熱和西尼羅病毒的專案。IBM 正在向 CINJ 捐贈一臺高效能 P6 570 系列伺服器和一個儲存系統,以提供資訊科技基礎設施,該基礎設施將與位於俄亥俄州立大學的計算機分擔執行新軟體的工作負載。