“長壽基因”研究中的重大缺陷浮出水面

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上週,波士頓大學的一組科學家報告說,他們已經鑑定出大量與異常長壽相關的基因變異。然而,自從該報道登上頭條以來,一些持懷疑態度的人對資料和研究結論表示了擔憂。

《新聞週刊》週三報道,對資料的擔憂源於波士頓大學科學家使用的一種研究工具——識別基因變異的DNA“晶片”。本質上,研究人員使用了兩種不同的晶片來分析參與其研究的人們的基因。杜克大學遺傳學家大衛·戈爾茨坦表示,這樣做的問題在於,每個晶片在識別變異方面都容易出現不同型別的錯誤。如果在同一項研究中使用幾種不同的晶片,可能會導致假陽性結果

避免假陽性的關鍵是確保使用完全相同的技術來分析病例組和對照組。戈爾茨坦說,如果您使用一種型別的晶片來分析病例組,而使用另一種型別的晶片來分析對照組,“您可能會看到在不同晶片上基因分型不同的任何[變異]‘亮起’,並明顯與該特徵相關聯”,而實際上這種模式只是實驗性的人為因素。


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《新聞週刊》的文章中,解碼遺傳學的創始人卡里·斯特凡松討論了先前發現的該研究中使用的一種晶片的問題,該晶片被稱為610-Quad晶片

……它在波士頓大學研究中與衰老相關的兩個最強變異(稱為rs1036819和rs1455311)方面存在奇怪且相關的怪癖。對於任何給定的基因,一個人將擁有兩個“等位基因”,即DNA的形式。在絕大多數人中,基因組中rs1036819和rs1455311位置上的這些等位基因對由一個“次要”形式和一個“主要”形式組成。但是,610-Quad晶片傾向於在這些特定位置看到錯誤的東西。斯特凡松說,它總是識別出“次要”形式,而不是“主要”形式,即使後者確實存在於DNA中,而通常情況下都是存在的。如果您在病例組中比在對照組中更多地使用容易出錯的晶片(就像波士頓大學的研究人員所做的那樣),那麼您將在這些病例中看到更多的錯誤。而且,由於您正在尋找的是病例中不尋常的模式,因此您很可能會將所有這些錯誤(即假陽性)誤認為是實際上不存在的遺傳聯絡。

 

批評者聲稱,透過對所有樣本使用單個新的晶片重複分析,可以輕鬆解決這些擔憂。許多人認為這應該在研究發表之前完成,因此引發了人們對該研究如何在沒有進行該操作的情況下被世界頂級研究期刊之一的《科學》雜誌接受發表的疑問。

週三,波士頓大學的科學家在準備好的宣告中回應了批評,指出他們知道自己使用的晶片存在技術錯誤,並且他們正在根據這一發現重新檢查他們的資料。然而,他們不認為該錯誤會影響其模型的整體準確性。

無論這場辯論的結果如何,該研究的作者都一再承認他們的模型尚未準備好供公眾使用,尤其不是以基因測試的形式使用(多家公司目前可能正在建立此類產品)。因此,如果您仍然希望瞭解自己可能活多久,那麼最好的選擇是忽略任何即將推出的基因測試,而只需檢視您的家譜。

iStockPhoto提供的DNA晶片影像

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