本文發表於《大眾科學》的前部落格網路，反映了作者的觀點，不一定反映《大眾科學》的觀點
DNA證據已被用於將嫌疑人與犯罪現場聯絡起來，甚至與他們可能感染艾滋病毒的人聯絡起來。現在，研究人員利用進化生物學的工具表明，他們可以在涉及男性在無保護性行為期間故意感染女性伴侶的刑事案件中確定艾滋病毒的傳播方向。
一篇新論文於11月15日在《美國國家科學院院刊》線上發表，解釋了系統發育方法如何揭示病毒在不同個體中進化的歷史，從而為誰將病毒傳播給誰提供“進化法醫”證據。
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“這是第一個確定傳播方向的案例研究，”貝勒醫學院的Mike Metzker和這項新研究的合著者在一份準備好的宣告中說。
“系統發育分析使我們能夠重建感染事件的歷史，”德克薩斯大學奧斯汀分校的David Hillis和這項新研究的合著者在一份準備好的宣告中說。“我們可以識別感染群中的來源，因為來自來源的一些艾滋病毒分離株將與每個接受者中的艾滋病毒分離株相關。”
艾滋病毒分析不像DNA篩查那樣簡單，DNA篩查用於將血液或頭髮樣本與個人進行匹配。Metzker說，在感染者中，“不僅僅有一種毒株，而是一個毒株群體，因為艾滋病毒在製造新的病毒粒子時會不斷變異。”為了解決這個問題，研究人員追溯到每個人體內可能的“共同祖先”病毒株，因為在傳播點，“存在一個遺傳瓶頸，其中只有一兩個病毒被傳播給接受者，”Metzker說。
對於兩個美國刑事案件（德克薩斯州訴菲利普·帕迪厄案和華盛頓州訴安東尼·尤金·惠特菲爾德案），Metzker和他的同事們分離並測序了從被告、受害者和附近居住的其他艾滋病毒陽性個體採集的血液樣本中發現的病毒的兩個基因區域（env和pol）。
在對盲法樣本（即研究人員不知道樣本來自被告、受害者還是其他人）進行系統發育分析後，Metzger、Hillis及其同事能夠確定哪個個體最有可能感染該組中的其他人。該分析與其他證據一起，促成了2009年帕迪厄（因六項持致命武器嚴重襲擊罪——艾滋病毒）和2004年惠特菲爾德（因17項一級襲擊罪）的定罪。
圖片由iStockphoto/jgroup提供