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這是一篇來自iGEM 競賽團隊(來自倫敦帝國理工學院)成員的客座文章。他們最近贏得了 iGEM 區域冠軍賽,並將於 11 月前往波士頓參加全球總決賽。這篇文章描述了他們夏季所做的工作,以及他們對 iGEM 經歷的感受。
夏天怎麼樣?我們不知道。我們在開發 iGEM 競賽專案時錯過了大部分夏天。不過我們不後悔,因為我們在 iGEM 歐洲區域性盛會上獲得了大獎,這讓所有的努力都值得了。
對於那些不瞭解 iGEM 的人來說,iGEM 代表國際基因工程機器大賽,這是一項全球本科生團隊之間的競賽。挑戰在於開發一個合成生物學系統,並在團隊設計的網站上以及透過演示和海報展示來展示結果。然後,各團隊前往區域性盛會,在那裡他們會被“稱重”、評估並頒發獎項。頂尖團隊將贏得在波士頓舉行的全球總決賽盛會的參賽資格,並有機會贏得大獎:令人垂涎的 BioBrick 獎盃。
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上週末,我們飛往阿姆斯特丹參加在阿姆斯特丹自由大學舉辦的歐洲盛會,我必須說,這太精彩了!我們獲得了與來自歐洲和非洲各地的團隊會面的絕佳機會,並討論了他們正在進行的專案。在觀看了一天如此精彩的演示之後,獲得大獎簡直是錦上添花。我們的專案 AuxIn 旨在透過使用細菌刺激植物根系生長來對抗荒漠化蔓延。增加的根系質量有助於固定土壤,防止土壤被風或雨水侵蝕。透過幫助植物建立強大的根系,我們可以幫助全球各地正在實施的現有植被恢復專案。
該系統由三個模組組成,我們將其命名為 PhytoRoute、Auxin Xpress 和 GeneGuard。在 PhytoRoute 中,我們表達了一種對植物根系釋放的化學物質敏感的受體。這與大腸桿菌的天然趨化性機制結合,使我們的細菌遊向植物根部。
Auxin Xpress 是我們用於分泌植物生長因子——生長素的模組。為此,我們從細菌Pseudomonas savastanoi中提取出生長素生產途徑,並在我們的大腸桿菌細胞中表達,我們正在將大腸桿菌用作我們系統的“底盤”。
我們的第三個模組 Gene Guard 誕生於圍繞我們系統的人為實踐。為了實施我們的專案,我們需要將細菌釋放到環境中。雖然我們諮詢了生態學家和其他專家關於這可能產生的影響,但仍然一直存在著我們的基因構建體傳播到本地土壤細菌的擔憂。因此,為了防止水平基因轉移,我們在我們的 AuxIn 質粒上表達了一種毒素,該毒素會導致任何吸收該質粒的細菌發生細胞裂解。除了我們的細菌之外的任何細菌都會裂解,因為我們的細菌從它們的基因組中表達抗毒素,而抗毒素無法傳遞給其他細菌。
當然,這僅僅是我們正在進行的工作的冰山一角;您可以在 我們的 wiki 上檢視更多詳細資訊。
老實說,我認為這個訊息還沒有完全消化,但我知道我永遠不會忘記當我們的名字被宣佈,團隊其他成員都跳起來慶祝的那一刻。不過,那還不是 iGEM 經歷中最棒的部分。這個夏天是我一生中最美好的夏天之一,這都要歸功於我的隊友和顧問們讓它變得如此有趣。致正在閱讀這篇文章的本科生們:參加 iGEM 吧。即使你必須組建自己的團隊,也要去做。你會喜歡它的每一分鐘。
然而,我們不是那種會固步自封的人,我們目前正在回到實驗室,為 11 月的全球總決賽盛會做準備。現在我們都開始上課了,這將變得更加困難,所以我們將不得不放棄我們所剩無幾的空閒時間。您可以在 我們的 wiki 上檢視我們的進展,或者在 Twitter 上關注我們 @ImperialiGEM11
祝我們好運!