iGEM布宜諾斯艾利斯:合成細菌群落

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每年,iGEM競賽鼓勵來自世界各地的本科生透過組織基因組的模組化片段來創造合成細菌機器。這是來自布宜諾斯艾利斯iGEM團隊關於競賽及其專案的客座文章。

我們很高興能作為第一支來自阿根廷的隊伍參加iGEM競賽。

作為未來眾多團隊中的第一個,我們肩負著巨大的責任,而起步非常艱難:我們必須從零開始建立實驗室,建立聯絡,並尋找贊助商,其中大多數人從未聽說過這項競賽。但我們充滿信心地完成了這一切,並從合成生物學領域的科學家和以前的iGEM團隊那裡獲得了大量支援。幸運的是,我們得到了包括我們的大學、UNU-Biolac 和阿根廷科學、創新和生產部 (MINCYT) 等多個組織的支援,他們在資金和信任方面都給予了我們支援。


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2012年4月,我們的大學舉辦了第一屆拉丁美洲EMBO全球交流講座課程,同時也是第一次拉丁美洲對合成生物學感興趣的人士的聚會。來自該地區的學生被邀請來學習和分享他們的想法。我們邀請了演講者,包括幾位第一批iGEM創始人。反響非常熱烈,大學接待了來自墨西哥到智利的學學生,結果非常棒:拉丁美洲是一個正在崛起的地區,對這門新興學科來說是一個美好的承諾。我們確信許多當地問題可以透過合成生物學來解決。此外,知識和技術的自由交流是競賽的基礎,是無價的。

本著這種精神,我們將社群建設的概念融入到我們的專案中,我們的目標是建立一個微生物群落,其中每個成員都處於定義的和穩定的比例。如果我們成功,這可以用作實驗室和工業的標準工具,定義模組化的新層次。該系統的設計基於“合成共生”,其中群落的每個成員產生並分泌其他成員生存所需的氨基酸。透過調節分泌的氨基酸量,我們原則上可以控制每個菌株的比例。

我們的目標是能夠控制共培養物中每個菌株的比例,就像生態系統中物種相互作用自然平衡一樣,我們使用了一個生物磚(如下圖所示)來控制Trp的輸出。“特洛伊木馬”是一類具有轉運特性的肽,能夠將訊號(His或Trp)跨過質膜進行分泌,並進入靶細胞(即另一個菌株)的質膜。

我們專案的可能應用是無限的:食品工業、生物反應器最佳化、生物修復和替代能源生成等等。它也將成為學術界和醫學研究的非常有用的工具,因為它將允許,例如,透過在不同菌株中分離不同的步驟來研究生物途徑,或者研究基因產物的相互作用,否則這些基因產物將不適合單個生物體。更重要的是,我們提案的創新之處在於我們正在引入一個新的模組化水平,因為我們的主要單元是實際工程改造的生物體,而我們的系統是整個群落。

作為我們人類實踐的一部分,我們與Garage Lab聯絡,這是一個由熱衷於技術和資訊學的阿根廷社會企業家組成的團體。我們計劃一起使用可以用iGEM試劑盒構建的重金屬檢測器來評估拉普拉塔河的汙染,這是布宜諾斯艾利斯的一個重大環境問題。 Jamboree之後工作將繼續進行 - 這僅僅是個開始!

有關團隊專案的更多資訊,請訪問他們的wiki頁面或他們的iGEM網頁

About S.E. Gould

A biochemist with a love of microbiology, the Lab Rat enjoys exploring, reading about and writing about bacteria. Having finally managed to tear herself away from university, she now works for a small company in Cambridge where she turns data into manageable words and awesome graphs.

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