本文發表於《大眾科學》的前部落格網路，反映了作者的觀點，不一定反映《大眾科學》的觀點
如果您設定了針對“抗生素耐藥性”的谷歌新聞提醒（或者像我一樣只是閱讀了瑪琳·麥肯納的文章），您不禁會感到害怕。 在對抗傳染性細菌的戰爭中，我們正在撤退。 從抗生素髮現的經濟障礙到美國出現新型超級細菌，似乎這場戰爭中的所有炮火都是由敵人發動的。
也許不足為奇的是，即使是嬰兒也無法倖免於這場戰鬥。 今年早些時候發表的研究分析了早產兒腸道微生物組的發育情況，並表明風險不僅僅是低出生體重。
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這項研究中的所有嬰兒在出生後不久都接受了至少一些抗生素治療。 這並不奇怪——早產兒感染的風險明顯更高。 話又說回來，這些嬰兒的腸道微生物種群發生顯著改變也並不奇怪。 之前的研究表明，腸道中擁有大量多樣性（許多不同的物種）是健康微生物組的標誌，但早產兒的多樣性明顯低於足月出生的嬰兒。
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抗生素治療並不能完全清除所有微生物，因此這個結果並不出乎意料，但很明顯，某些抗生素的影響比其他抗生素更大。 有趣的是，這些嬰兒出生前的孕周（胎齡）越大，他們的微生物就越多樣化，並且用母乳餵養而不是配方奶粉也提高了多樣性。 尚不清楚這些因素是否與抗生素的使用存在因果關係，儘管早產兒通常不太健康，並且更有可能接受更長時間的抗生素療程。
這些資料顯然引起了治療早產兒的醫生的興趣，但對於我們其餘人來說，新聞始於圖 2。 作者推斷，這群在醫院花費大量時間並在早期接受抗生素治療的弱小人群很可能攜帶抗生素耐藥細菌。 為了驗證這一假設，他們收集了宏基因組資料，以尋找潛在的抗生素耐藥基因的存在。
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編碼最多 AR [抗生素耐藥性] 基因的三種物種（大腸桿菌、陰溝腸桿菌和肺炎克雷伯菌）包括屬於 ESKAPE 病原體家族的生物，並且廣泛分佈於新生兒重症監護病房環境中
許多這些耐藥基因尚未被表徵，但預計會導致耐藥性，因為它們看起來像其他耐藥基因。 比他們發現的 AR 基因數量更令人不安的是，耐藥性的富集並不侷限於所用抗生素的型別。 有許多不同類別的抗生素，它們針對細菌生命週期的不同部分。 通常，使微生物能夠抵抗一種抗生素的基因也會增加對同一類別中抗生素的耐藥性。 同時，您只會期望抗生素治療會選擇對該類別的耐藥性。 但這些作者發現，用一類抗生素治療這些嬰兒會導致對許多其他類別的抗生素的耐藥基因丰度增加。