開放科學實驗——我的發酵日誌

我堅信,科學,特別是用公共資金進行的學術科學,應該向所有人開放。

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本文發表於《大眾科學》的前部落格網路,反映了作者的觀點,不一定代表《大眾科學》的觀點


我堅信,科學,特別是用公共資金進行的學術科學,應該向所有人開放。我有點處於這種信念的激進邊緣,因為我認為不僅應該分享已發表的結果,還應該分享實驗室筆記和正在進行中的工作。

唉,由於科學也是協作性的,我實際上不能自己做出這個選擇。開放性存在結構性障礙——也就是說,由於發表物是唯一重要的貨幣,洩露的資料/想法可能會被其他人搶走。如果他們發表了,就沒有機制讓我因為我產生的東西而獲得認可。在我幻想的未來,科學出版物可以連結到部落格文章/個人網頁作為引用(這樣我的帖子就可以有“影響因子”),但這並非我們所處的世界。

當(希望有一天)我有了自己的實驗室時,我打算無論如何都參與這種激進的開放性,但科學的協作性質意味著我幾乎永遠不能僅僅為自己做出這個決定。我必須向學生、博士後和合作者披露這種情況,我懷疑很多人不願意承擔風險。而且我當然不能在我仍然只是一個博士後的時候就採取這種立場。如果我分享我實驗室的想法/結果,我不僅會冒著自己職業發展的風險,還會冒著我的PI和實驗室其他成員的風險。


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所以,我不能告訴你我在實驗室裡做什麼(它涉及到乳酪和乳酪微生物!)。但我可以告訴你我自己的發酵實驗。而且我已經做過。為了嘗試使用開放的實驗筆記本,並且因為我不能每次開始新的發酵就寫一篇帖子(說真的,我目前有大約5個在進行中),我正在分享我的印象筆記發酵筆記本

我還正在建立一個個人部落格,用於討論開放科學、我在python編碼方面的冒險(我正在為實驗室做一些基本的生物資訊學)和其他東西。敬請期待!

Kevin Bonham is a Curriculum Fellow in the Microbiology and Immunobiology department at Harvard Medical school. He received his PhD from Harvard, where he studied how the cells of the immune system detect the presence of infectious microbes. Find him on Google+, Reddit.

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