本文發表於《大眾科學》的前部落格平臺，反映作者的觀點，不一定代表《大眾科學》的觀點。
每年我都會邀請一些 ScienceOnline 會議的參會者，讓他們更詳細地介紹他們自己、他們的職業生涯、當前的專案以及他們對網路在科學、科學教育或科學傳播中的看法。現在我們繼續採訪 ScienceOnline2012 的參與者。檢視本系列所有訪談請點選 此處。
今天我的嘉賓是肖恩·埃金斯。肖恩·埃金斯是一位科學家，他在 Collaborations in Chemistry 工作，同時以 CollabChem 的名義寫部落格和發推文。他與世界各地的其他科學家合作進行藥物發現、毒理學計算方法、協作工具、科學移動應用程式（綠色溶劑、開放藥物發現團隊、TB Mobile）。他是美國三所大學（北卡羅來納大學教堂山分校、馬里蘭大學和 UMDNJ）的兼職教師，並在多家公司和組織（如 Pistoia Alliance）的董事會任職。他目前專注於被忽視的疾病研究，以及我們如何為罕見疾病公開進行藥物發現。他專注於技術，大部分時間都在寫作，偶爾也會贏得 SBIR 和 STTR 資助，以便他合作的團隊能夠進一步發展他們的想法。他喜歡和朋友一起喝杯好啤酒，也喜歡給兩個年幼的孩子讀書。
歡迎來到“環繞時鐘的部落格”。請您向我的讀者詳細介紹一下您自己好嗎？您來自哪裡（地理位置和哲學思想方面）？您的背景是什麼？接受過科學教育嗎？
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我出生於克利索普斯，在附近的格里姆斯比（一個工業區，就像新澤西州的伊麗莎白，但在英國東海岸）長大，直到 18 歲。我對生物學產生了興趣，因為我的叔叔在他去醫學院的時候把他的一些高中課本留在了我祖父母家，我喜歡翻閱它們。最終，我會學習我小時候讀過的同一本書的最新版本。我總是記得克里克和沃森的照片，原因不明。所以我想成為一名醫生，但這個想法被扼殺了。我設法大部分考試都不及格（除了生物學），勉強考上了諾丁漢特倫特理工學院。
然後我獲得了應用生物學 HND 文憑，並在 Servier（一家法國製藥公司，在溫莎附近設有一個研發基地）工作了一年，這真的讓我重回正軌。之後，我去了阿伯丁大學（蘇格蘭）攻讀臨床藥理學碩士學位，然後留在那裡攻讀博士學位。所以我成了一種不同的醫生。到那時，我對藥物代謝和理解藥物如何表現或相互作用的不同模型產生了興趣，我的目標是在製藥行業工作。在 90 年代初期，英國的製藥行業開始衰落並急劇萎縮，所以我認為我最好去美國做博士後。1996 年，我來到印第安納波利斯，在禮來公司工作，這真的讓我重新開始了，有點像重生。
請詳細介紹一下您迄今為止的職業生涯軌跡：過去和現在有趣的的專案？
因此，一旦來到美國，我便開始在禮來公司做與我在阿伯丁所做的類似的工作，但專注於一種參與藥物代謝的酶 (CYP2B6)。基本上這是沒人太感興趣的“弱勢群體”。但這給了我一些靈活性，我開始涉足計算軟體，以瞭解哪些分子可能與我的酶結合。我基本上開始了一項新的職業，從事計算藥物代謝或化學。我玩得很開心，並意識到我可以對我同事正在研究的每種酶做同樣的工作。那是一段瘋狂的時期，白天我在實驗臺工作，晚上在電腦上工作。因此，在集中式資料庫出現之前，我從公告板上提取了他們產生的資料（所有資料都在一張紙上），並用它來建模該小組研究的每種酶。
然後我離開去了輝瑞公司，帶著自己的團隊從事藥物-藥物相互作用預測工作，同時繼續關注計算方面。禮來公司隨後迅速聘請我回去領導一個新的計算 ADME/Tox 團隊。基本上做著我做博士後時所做的事情，但現在資料集越來越大，因為他們開始對許多毒理學和代謝相關特性進行高通量篩選。到 1999 年，我 100% 成為了一名計算機科學家（使用計算機進行我所有的科學研究）。我也在這個時候開始與學術界的一些人士合作，這使我能夠在禮來的專有工作之外發表研究成果，這一直是持續到現在的線索，每年都會增加更多的合作者。
我的下一步是在 2001 年末加入一家初創公司，該公司主要使用計算工具進行藥物發現。我在那裡待到 2004 年，然後加入了一家軟體公司（最終於 2010 年出售給湯森路透），該公司開發系統生物學工具（本質上是將收集到的所有生物學資料聯絡起來，並將所有基因組學和蛋白質組學資料疊加起來）。我現在更專注於將我的藥物-藥物相互作用模型整合到這些工具中，並從事資助專案。
正是在這個時候，我開始在家辦公，並且一直這樣做。到 2004 年，我已經積累了大量關於預測藥物相互作用的出版物，因此我在 2005 年獲得了阿伯丁大學的 DSc（科學）學位。我的下一個重點轉變是獲得機會為 Wiley 編輯一本關於藥物研究和開發的計算應用的書籍，大約在同一時間。這為我打開了編輯一系列書籍（迄今為止共 10 本）的大門，並與他人合著了另外 3 本關於毒理學計算方面、新興技術和合作的書籍。
從 2006 年到 2008 年，我為小型公司和初創公司工作，獲得資助和合同，從事藥物發現和藥物經濟學方面的工作。然後，我在禮來的老計算化學導師向一家位於舊金山的軟體公司推薦了我，該公司正在開發一個供科學家協作的資料庫。從那時起，我一直在為他們從事被忽視的疾病（肺結核和瘧疾）方面的工作，每週工作 3 天，留出一些時間繼續我的學術合作和其他諮詢工作。
我很幸運，我的工作周很少變得枯燥。我參與各種各樣令人驚歎的專案，例如透過檢視與核受體結合的膽汁鹽譜並在計算機中對其進行建模來了解不同物種核受體的進化。另一天，我可能會構建人類藥物轉運蛋白模型，並預測哪些其他藥物可能是底物或抑制劑。我可能會預測一家制藥公司的哪些分子可能與一種名為 hERG 的離子通道相互作用，以幫助預測可能的心臟毒性（這可以追溯到我在禮來公司的工作）。我也可能會搜尋 FDA 批准的藥物，看看是否可以找到針對罕見疾病的新用途，或者思考我們可以用作新的科學移動應用程式基礎的資料集。而這僅僅是我每週安排的 2 天！
目前什麼佔據了您最多的時間和熱情？您的目標是什麼？
我的大部分時間都集中在證明我們可以使用針對結核分枝桿菌篩選的化合物積累的大量資料來構建模型，這些模型反過來可以用於建議要測試的分子。透過這種方式，我們可以顯著地減少測試化合物的數量。所有這些資料都是公開可訪問的。我還認為，這種方法可以推廣到其他研究領域。我們正在積累資料，但學習速度不夠快，無法設計下一個實驗。當我不做這些事情時，我越來越關注資料質量以及我們認為理所當然的一些事情，例如——為什麼 NIH 會發佈一個包含重大錯誤的資料庫，或者一個沒有結構的潛在藥物列表？我將 50% 或更多的時間用於撰寫論文以發表我的觀察結果，或為公司或與學者一起撰寫資助申請。我很少自己寫任何東西，所以一切都是合作完成的。
很難準確預測我明年會從事什麼工作——我嘗試離開某些領域，跳入新的領域，因為我發現某個專案或合作者在做一些有趣的事情，我認為我可以做出貢獻。我發現這樣做會付出從頭開始的代價，與全新的審稿人建立您的信譽等等。您有多少論文、多少引用或您的 h 指數是多少都無關緊要，因為一旦您從事您從未發表過的任何事情（例如，綠色化學或任何其他領域），或者嘗試向新期刊投稿，我發現我會在這類過渡性論文上花費大量時間。一旦您被接受，一切都會容易得多。
我喜歡進入新的領域，因為您會看到那些多年專注於該領域的人看不到的東西。例如，綠色溶劑應用程式的出現是由於我有機會參加一個綠色化學會議，並隨機選擇一個關於綠色溶劑的講座來聽。一個小組花了兩年時間整理製藥公司的資料，然後只是將其隱藏在 PDF 中。由於我對這個主題完全陌生，我問是否有包含所有資料的應用程式，並在推特上釋出了這個想法。蒙特利爾的 Alex Clark 做出了回應，然後在幾天內構建了該應用程式並將其釋出到應用程式商店。然而，花了將近一年時間才寫出一篇關於該主題的論文並被接受，因為我們面臨著老牌科學家不理解其價值的艱苦鬥爭。
所以我想說，我的熱情在於進入新的領域，建立自己的地位，並在短時間內發表文章和學習大量知識。我正在與時間賽跑，在罕見疾病方面的工作中，我更加深刻地感受到了這一點，因為大約有 7000 種罕見疾病，但很少有治療方法，更不用說治癒方法了。我對它們的瞭解非常少，而 7000 種疾病就像一座珠穆朗瑪峰。我遇到了一位患有快速進展性神經系統疾病的孩子的父母，這真的讓我停下來思考如何利用我多年來研究的所有工具來幫助他們，我們如何才能加速和顛覆製藥研發——實際上，這意味著要將研發速度提升到超過過去 50 年的水平。這又是適應變化的另一個例子，一些愛抱怨的暴發戶說讓我們試試這種方法。每種罕見疾病的偉大之處在於，兒童的父母或患者可能遠遠多於研究人員，因此權力平衡掌握在他們手中，他們籌集資金並資助研究人員去做他們需要做的事情等等。
因此，我的目標是盡我所能地進行科學研究來幫助這些人，同時透過免費應用程式或開放論文等方式儘可能多地將我所做的事情重新投入流通。我 2013 年的目標是將我撰寫的每一篇論文主要發表在開放期刊上。
您對科學傳播的哪個方面和/或網路在科學中的特定用途最感興趣？
我喜歡在網路上立即釋出想法的速度，而不是寫論文、接受審稿以及可能在幾個月後才看到它付印的過程。我也喜歡能夠發表演講或海報，並將我的幻燈片放在 slideshare、figshare 等網站上，以便任何人都可以找到它們。
我對科學的創造性部分著迷。在進行導致最終論文想法的研究之前，我很少有最終論文想法的遠見（或頓悟時刻）。但我可以看到，使用網路和其他工具可能會加速科學發展到撰寫也必須自動化或加速的地步。哪些工具可以幫助產生想法？我在電腦上進行我所有的科學研究，我所有的論文都是在電腦上寫的……為什麼不也讓電腦為我提供所有的想法呢？在啤酒墊或餐巾紙背面寫字是一回事，但 iPad 是一個好的替代品嗎？我曾用手機寫部落格（很痛苦），在行駛的汽車裡用 iPad 寫部落格（非常慢），所以我認為它實際上並不是“隨時隨地透過任何裝置進行科學傳播”。一個固定的位置會有所幫助，一些紙張來起草想法也很方便。當我打字寫下這些話時，我正坐在堆滿紙張和筆記的筆記型電腦旁。
部落格在您的工作中是如何體現的（如果有的話）？社交網路，例如 Twitter、Google Plus 和 Facebook 呢？您是否發現所有這些線上活動對您所做的事情來說是淨收益（甚至是必要的）？
我經常寫部落格，內容涉及我看到的任何科學方面的東西，也許是我自己或其他人的科學出版物。我對協作元素很感興趣，這可能是我的主題與眾不同的地方，即協作角度。
我發現，透過將我正在思考的東西（無論是好是壞）釋出到網路上，我可以從中獲得即時的滿足感。我的部落格已經開始了合作，它們促成了許多論文的發表。我甚至有一位 NIH 的高階官員，在我的一篇部落格引起他們的注意後，透過電子郵件向我和大約 70 位其他科學家傳送了一封咆哮信。如果他們將這封信釋出在我的部落格上會更好，因為全世界都可以看到他們的想法，而不僅僅是一部分選定的受眾。我也曾有其他經驗豐富的科學家在我的部落格上支援我的觀點。
我發推文（我來得很慢），更多的是在會議上，我反過來將其用於產生想法和作為持久的記憶裝置。對我來說，它只是技術發展的延伸和營銷理念，因為我釋出推文連結到部落格、幻燈片、海報、論文等……我有網站、LinkedIn 等，這些有助於帶來業務，但我的科學合作主要透過我認識的人、他們的關係和個人互動來實現。我發現電子郵件群發、部落格和推文偶爾也會帶來合作。在我看來，網路是另一個接觸人們的工具。我沒有生活在其中。我與它共存。
您何時以及如何首次發現科學部落格？您最喜歡哪些？您是否在會議上發現了任何很酷的 參會者的科學部落格？
我長期以來一直在閱讀我的朋友 Antony Williams 的部落格“ChemConnector”。幾年前，我的妻子向我推薦了“In the Pipeline”，我非常喜歡它，因為它的話題與製藥相關，評論通常也很有趣。自從 ScienceOnline 以來，我一直在關注許多參會者，他們指出了許多優秀的部落格，因此我的視野開闊了。我必須合理安排使用 Twitter 和 Flipboard 的時間，但我會推薦 David Kroll，他的文章寫得非常清楚。
對您來說，ScienceOnline2012 最好的方面是什麼？對明年有什麼建議？在本次會議上是否發生了任何事情——一個環節、某人說的話或做的事或寫的東西——會改變您對科學傳播的看法，或者您將帶到您的工作、部落格閱讀和部落格寫作中的東西？
關於“資訊過載”和“開放科學”的環節對我來說是亮點。前者讓我想到一個應用程式，它可以將來自網路和 Twitter 的所有資訊彙集在一起。我再次有機會與 Alex Clark 合作開發這個應用程式，我們在 2012 年初發布了它，名為 Open Drug Discovery Teams（科學領域的 Flipboard）。我們將其重點放在罕見疾病主題上，以便我們可以幫助人們分享想法、分子和資料，它激發了一項 IndieGoGo 籌款活動、許多海報、一篇論文、一個 Youtube 影片等等。我認為它仍在興起，並有可能被開發用於其他用途。在過去的一年中，我已將分子和資料推送到其中，因此我可以看到其潛力。如果我沒有參加這次會議，我懷疑這個應用程式是否會被開發出來。我很想看看人們會提出哪些與會議直接相關的想法——也許它可以擴充套件我的理論，即會議現在與其說是社交網路，不如說是有用的想法生成器。
來自社群的其他部落格的標準使我提高了我釋出內容的質量，我還有很長的路要走，但如果我寫的東西能讓某人有心情嘗試一些計算工具或聯絡合作，我就會有所成就。因此，如果下次會議上有需要客座博主或有人將他們的資料扔給我進行建模的人，請聯絡我。如果您有改進我釋出內容的想法，我也想聽到。
Antony Williams 讓我意識到，部落格和我們在網路上釋出的所有內容與所有論文和專利一樣重要，因為這也可以用於替代計量學。參加 ScienceOnline2012 讓我意識到，還有數百名其他科學家與我處於相同的波長。科學傳播很重要，有很多方法可以做到這一點，即使是 Twitter 也可以作為科學工具使用。