2005年9月26日，聯邦法院在賓夕法尼亞州哈里斯堡剛剛休庭，那是多佛智慧設計審判的第一天。評論員稱之為“示波器審判”II或III，取決於他們知道之前有多少起進化教育案件。被告，即賓夕法尼亞州多佛學區委員會的成員，曾要求向九年級生物學生宣讀一份貶低進化論的宣告，並建議將所謂的智慧設計視為一種可行且在智力上充分的替代方案。原告是學區的家長，他們聲稱智慧設計（或ID）實際上是一種宗教建構，因此在公立學校的科學課上向他們的孩子介紹它違反了美國憲法第一修正案的國教條款。
一場持續的雨迫使原告、被告、證人和媒體聚集在哈里斯堡聯邦大樓和法院入口處的屋簷下。在幾分鐘前將進化論本身推上審判席的倡導者幾英尺遠的地方，站著尤金妮·斯科特。作為國家科學教育中心（NCSE）的執行主任，她是美國進化教育的最傑出捍衛者。她耐心地向記者解釋了為什麼這次審判如此重要：“這是第一個審議反進化運動的兩種當前策略的合法性的案件。”
第一種策略是倡導智慧設計——生命或生命的某些方面過於複雜，不可能自然產生，因此一定是智慧設計者的產物。“創造科學是進化論最初的科學替代方案，”在審判期間年滿60歲的斯科特說，“而智慧設計是當今進化論的科學替代方案。它基本上是創造科學的一個子集。智慧設計以前從未受審判過。”
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第二種策略，即對進化科學提出質疑，其根源在於1987年，當時美國最高法院在愛德華茲訴阿吉拉德案中以7比2的裁決認定，神創論是宗教性的，因此不符合納入公立學校生物課程的資格。斯科特解釋說，大法官威廉·J·布倫南在他的多數意見中寫道，教師有權教授進化論的科學替代方案，“他們當然會這樣做”。“如果有什麼替代方案，他們將有權教授它們。”
但安東寧·斯卡利亞大法官在他的異議中（首席大法官威廉·H·倫奎斯特也加入了他的異議）寫道，“可能存在任何反對進化論的科學證據”也可能“在他們的學校中呈現”。因此，一種策略是將對進化論的每一個細節都缺乏確定性——所謂的進化生物學家之間關於機制的差距或誠實的異議——描繪成反對進化論的證據。
多佛審判涉及關於反對進化論和智慧設計的證據的論證。對於斯科特來說，“這是一個夢想的條件，因為我們有望挑戰這兩個組成部分。”斯科特的夢想顯然是被告的噩夢。位於西雅圖的支援智慧設計的探索研究所的成員本應作為辯方證人出庭，但他們撤回了證詞，理由是他們希望在取證期間由自己的律師代表。斯科特說，“他們撤回了A隊，我認為這表明他們正在止損。”
多佛只是斯科特訪問過的最新熱點。NCSE在加利福尼亞州奧克蘭的辦公室裡有一張美國地圖，地圖上標有挑戰進化教育的地點。“在中部地區以及馬里蘭州、賓夕法尼亞州、田納西州，數量驚人，”她指出。“然後在加利福尼亞州、德克薩斯州和堪薩斯州，當然還有堪薩斯州，形成了一個叢集。”堪薩斯州仍然是關於進化教育的戰場，斯科特最初是在那裡直接參與戰鬥的。
1974年，在加入肯塔基大學擔任體質人類學家後不久，她參加了密蘇里大學的一場辯論，辯論雙方是她的導師吉姆·加文和當時新興的科學神創論運動的領導人杜安·吉什。她開始收集神創論文獻並研究信徒的方法。1976年，作為堪薩斯大學的客座教授，她準備為兩位與吉什和神創論者亨利·莫里斯辯論的生物學教授提供建議。她稱之為“真正的洗禮”發生在1980年，當時她為肯塔基州列剋星敦教育委員會提供建議，該委員會最終拒絕了一項關於將起源的“平衡”教學納入其中的請求。[中斷]
尤金妮·斯科特說，多佛審判是一個夢想的條件——它挑戰了智慧設計和對進化論的質疑。
認識到神創論運動將繼續下去，一群科學家和教育家於1981年成立了NCSE。“這是一個旨在在基層反對神創論的組織，”當時還在外圍的斯科特解釋說，“因為問題就在那裡。教育是分散的，所以戰鬥必須是地方性的。”
1986年，她成為NCSE的執行主任。她目前的職業生涯與學術生涯非常相似。“我仍然在教學。我只是在廣播節目中教學，或者我正在向記者講解細節。我在大學教授時所擁有的許多相同技能都參與其中——將複雜的想法提升到讓任何與你交談的人都能理解的水平。”
除了嚴謹的智力和毅力外，斯科特還以她的隨和而聞名。托馬斯·赫胥黎被稱為達爾文的鬥牛犬，這導致了對進化論捍衛者的其他犬類比喻。優雅而富有侵略性的理查德·道金斯被稱為達爾文的靈緹犬。斯科特認為，快速而專注的布朗大學生物學家肯·米勒（一位虔誠的天主教徒，也是多佛案的第一位證人）是達爾文的邊境牧羊犬。“而我是達爾文的金毛尋回犬，”她說。“在我與神創論者的個人關係中，我一直非常努力地保持文明，並且從不涉及個人。”
成為一個快樂的戰士既是斯科特的本性，也可能是她和她這一方爭取支援的最佳方式。“對我而言，她最令人印象深刻的成就是她為支援科學教育而團結起來的非常多樣化的人員和組織的聯盟——尤其是神職人員，”威斯康星大學麥迪遜分校的分子生物學家和遺傳學家肖恩·卡羅爾說。“因為當嚴肅的宗教人士公開支援進化論時，人們會傾聽。”
完全勝利可能還需要很長時間才能到來，數千個地方學區正在做出課程決定。事實上，公共科學教育面臨的威脅可能正在增加：天文學和宇宙學也可能冒犯宗教原教旨主義者。在2005年她第一次參加美國天文學會會議時，她說：“我走不了五碼，就會有人走到我面前對我說，‘讓我告訴你我在教授大爆炸時遇到的問題，讓我告訴你我在教授太陽系形成時遇到的問題，等等。’”
2005年12月20日，約翰·瓊斯法官釋出了一份長達139頁的措辭嚴厲的判決，支援原告，他在判決中稱學區委員會要求反進化論免責宣告的決定是“令人震驚的愚蠢行為”。他還強有力地指出，智慧設計不是科學，“希望它可以防止隨後的審判造成的明顯的司法和其他資源的浪費。”斯科特宣佈瓊斯的判決是科學和教育的勝利，但也預測法官的希望將落空。“這就像一張水床，”她談到反進化論時說。“你把它在一個地方壓下去，它會在另一個地方彈起來。”事實上，堪薩斯州教育委員會最近以6比4的投票結果通過了允許在公立學校教授智慧設計的決議。斯科特似乎很清楚，她不會很快失業。