軟綿綿的科學:從搗碎的草莓中提取 DNA

來自 Science Buddies 的一項基因活動

核心概念
DNA
基因組
基因
提取
實驗室技術

簡介
你有沒有想過科學家是如何從生物體中提取 DNA 的?所有生物體都具有 DNA,DNA 是脫氧核糖核酸的簡稱;它基本上是生物體細胞內發生的一切事情的藍圖。總的來說,DNA 告訴生物體如何發育和運作,而且非常重要,以至於這種複雜的化合物幾乎存在於其每一個細胞中。在這個活動中,你將用家用化學品製作自己的 DNA 提取試劑盒,並用它從草莓中分離 DNA。 
  
背景
無論你是人類、老鼠、番茄還是細菌,你的每個細胞內部都會有 DNA(除了一些罕見的例外,例如人類成熟的紅細胞)。每個細胞都擁有相同的一整套指令副本,這套指令被稱為基因組。科學家研究 DNA 的原因有很多:他們可以弄清楚儲存在 DNA 中的指令如何幫助你的身體正常運作。他們可以使用 DNA 來製造新藥或對作物進行基因改造,使其具有抗蟲性。他們可以找出犯罪嫌疑人,甚至可以使用古代 DNA 重建進化歷史!

為了從細胞中獲取 DNA,科學家通常依賴於生物技術公司提供的多種 DNA 提取試劑盒之一。在 DNA 提取過程中,一種洗滌劑會使細胞破裂或裂解,從而將 DNA 釋放到溶液中。然後,新增到溶液中的酒精會導致 DNA 沉澱出來。在這個活動中,將使用草莓,因為每個草莓細胞都具有八個基因組副本,從而使每個細胞具有大量的 DNA。(大多數生物體每個細胞只有一個基因組副本。)


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材料

  • 外用酒精

  • 量杯

  • 量勺

  • 洗碗液(用於手洗碗碟)

  • 玻璃杯或小碗

  • 粗棉布

  • 漏斗

  • 高腳玻璃杯

  • 三個草莓

  • 可重新密封的塑膠三明治袋

  • 小玻璃罐(例如香料罐或嬰兒食品罐)

  • 竹籤,可在大多數雜貨店購買。(如果您使用嬰兒食品罐或短香料罐,可以用牙籤代替竹籤。)

 

準備工作

  • 將外用酒精放在冰箱冷凍室中冷藏。(您稍後會用到。)

  • 在一個玻璃杯或小碗中混合半茶匙鹽、三分之一杯水和一湯匙洗碗液。將混合物放在一邊。這是您的提取液。您認為提取液中為什麼會有洗滌劑?

  • 用粗棉布將漏斗完全襯好。將漏斗管插入高腳玻璃杯中(而不是裝有提取液的玻璃杯)。

  • 去除並丟棄草莓的綠色頂部。

 

步驟

  • 將草莓放入可重新密封的塑膠三明治袋中,並排出所有多餘的空氣。將袋子密封好。

  • 用手指擠壓並搗碎草莓兩分鐘。搗碎的草莓看起來怎麼樣?

  • 向袋子裡的草莓中加入三湯匙您準備好的提取液。排出所有多餘的空氣並重新密封袋子。您認為洗滌劑和鹽會如何影響草莓細胞?

  • 用手指擠壓草莓混合物一分鐘。現在搗碎的草莓看起來怎麼樣?

  • 將袋子裡的草莓混合物倒入漏斗中。讓它滴過粗棉布並進入高腳玻璃杯中,直到漏斗中剩餘的液體很少(只剩下溼漿)。過濾後的草莓汁看起來怎麼樣?

  • 將高腳玻璃杯中的過濾後的草莓汁倒入小玻璃罐中,使罐子達到四分之一滿。

  • 量出半杯冷的外用酒精。

  • 傾斜罐子,非常緩慢地將酒精沿其側面倒入。倒入直到酒精在草莓汁的頂部形成大約一英寸深的層。您可能不需要所有半杯酒精來形成一英寸的層。不要讓草莓汁和酒精混合。

  • 研究罐子內部的混合物。草莓 DNA 將以粘稠的透明/白色線狀物質形式出現。您在罐子裡看到了可能是草莓 DNA 的東西嗎?如果有,它在罐子的什麼位置?

  • 將竹籤浸入罐子中草莓汁和酒精層相遇的地方,然後將竹籤拉起。您是否看到任何可能粘在竹籤上的東西是 DNA?您能將任何 DNA 纏繞到竹籤上嗎?   

  • 額外:您可以嘗試對許多其他東西使用此 DNA 提取活動。從廚房裡拿些燕麥片或獼猴桃再試一次!哪些食物給您的 DNA 最多?

  • 額外:如果您可以使用毫克秤(稱為天平),您可以測量您獲得的 DNA 量(稱為產量)。只需稱一下您乾淨的竹籤,然後再稱一下您用它從草莓 DNA 提取物中取出儘可能多的 DNA 後的竹籤。從竹籤的帶 DNA 的重量中減去竹籤的初始重量,即可得到 DNA 的最終產量。您的 DNA 產量的重量是多少?

  • 額外:嘗試調整此活動中的不同變數,看看如何改變草莓 DNA 的產量。例如,您可以嘗試從不同量的草莓開始,使用不同的洗滌劑或不同的 DNA 來源(例如燕麥片或獼猴桃)。哪些條件能給您帶來最佳的 DNA 產量?

觀察和結果
當您加入冷的外用酒精時,您是否能夠在小罐子裡看到 DNA?DNA 主要是在酒精層中以及酒精層和草莓汁層之間嗎?

當您將鹽和洗滌劑混合物新增到搗碎的草莓中時,洗滌劑幫助溶解(開啟)草莓細胞,將 DNA 釋放到溶液中,而鹽幫助創造了一種環境,使不同的 DNA 鏈可以聚集和聚整合團,從而更容易看到它們。(當您新增鹽和洗滌劑混合物時,您可能主要只是看到袋子中因洗滌劑而形成更多的氣泡。)在您將冷的外用酒精新增到過濾後的草莓汁後,酒精應該將 DNA 從液體中沉澱出來,而其餘的液體仍保留在溶液中。您應該在酒精層以及兩層之間看到白色/透明的粘稠 DNA 鏈。一根 DNA 鏈非常小,肉眼看不見,但是由於 DNA 在此活動中聚整合團,因此您能夠看到當三個草莓的所有八倍體細胞組合在一起時,它們含有多少 DNA! (“八倍體”意味著它們具有八個基因組。)

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來自斯坦福大學醫學院創新技術博物館的關於遺傳學
來自猶他大學 Learn Genetics 的DNA 提取虛擬實驗室
來自 Science Buddies 的自己動手製作 DNA

 

此活動與Science Buddies合作推出

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