河豚基因組應能揭示我們自身的秘密

加入我們的科學愛好者社群!

將有毒的河豚魚紅鰭東方魨作為比較物件似乎不太可能,但它將告訴我們很多關於我們自身的資訊。這是由一個國際研究聯盟所說的,他們在加利福尼亞州聖地亞哥舉行的第13屆國際基因組測序與分析會議上宣佈了這種生物基因組的測序結果。

河豚魚基因組基本上包含與人類基因組相同的基因和調控序列——但沒有所有所謂的垃圾 DNA。事實上,人類基因組包含近 30 億個鹼基對,而河豚的基因組只有 3.65 億個這樣的資訊單位。科學家們表示,有了緊湊的河豚基因組作為指導,在相對雜亂的人類基因組中定位基因將容易得多。

為了對河豚基因組進行測序,研究人員採用了所謂的全基因組鳥槍法策略。“我們首先將基因組切成足夠小的片段進行測序,”位於加利福尼亞州核桃溪聯合基因組研究所的團隊成員丹·羅克薩爾 (Dan Rokhsar) 解釋說。“當時的挑戰是將近四百萬個重疊的片段重新組裝在一起——就像拼一個巨大的拼圖一樣。” 科學家們使用一種複雜的計算演算法迎接了這一挑戰。


關於支援科學新聞業

如果您喜歡這篇文章,請考慮透過以下方式支援我們屢獲殊榮的新聞業 訂閱。透過購買訂閱,您將幫助確保未來能夠繼續講述關於塑造我們當今世界的發現和想法的具有影響力的故事。


新加坡分子與細胞生物學研究所的陳譚 (Chris Tan) 指出,河豚基因組的測序將使人類基因庫的估計更加準確。他補充說,“我們現在也能夠改進許多非編碼區域的特徵,這些特徵可能被證明對人類基因組中表達的基因具有調控控制作用。”

"Beyond the Human Genome," by Carol Ezzell (大眾科學, July 2000), is available for purchase on 大眾科學.

Kate Wong is an award-winning science writer and senior editor at 大眾科學 focused on evolution, ecology, anthropology, archaeology, paleontology and animal behavior. She is fascinated by human origins, which she has covered for more than 25 years. Recently she has become obsessed with birds. Her reporting has taken her to caves in France and Croatia that Neandertals once called home, to the shores of Kenya's Lake Turkana in search of the oldest stone tools in the world, to Madagascar on an expedition to unearth ancient mammals and dinosaurs, to the icy waters of Antarctica, where humpback whales feast on krill, and on a "Big Day" race around the state of Connecticut to find as many bird species as possible in 24 hours. Kate is co-author, with Donald Johanson, of Lucy's Legacy: The Quest for Human Origins. She holds a bachelor of science degree in biological anthropology and zoology from the University of Michigan. Follow Wong on X (formerly Twitter) @katewong

More by Kate Wong
© .