將有毒的河豚魚紅鰭東方魨作為比較物件似乎不太可能,但它將告訴我們很多關於我們自身的資訊。這是由一個國際研究聯盟所說的,他們在加利福尼亞州聖地亞哥舉行的第13屆國際基因組測序與分析會議上宣佈了這種生物基因組的測序結果。
河豚魚基因組基本上包含與人類基因組相同的基因和調控序列——但沒有所有所謂的垃圾 DNA。事實上,人類基因組包含近 30 億個鹼基對,而河豚的基因組只有 3.65 億個這樣的資訊單位。科學家們表示,有了緊湊的河豚基因組作為指導,在相對雜亂的人類基因組中定位基因將容易得多。
為了對河豚基因組進行測序,研究人員採用了所謂的全基因組鳥槍法策略。“我們首先將基因組切成足夠小的片段進行測序,”位於加利福尼亞州核桃溪聯合基因組研究所的團隊成員丹·羅克薩爾 (Dan Rokhsar) 解釋說。“當時的挑戰是將近四百萬個重疊的片段重新組裝在一起——就像拼一個巨大的拼圖一樣。” 科學家們使用一種複雜的計算演算法迎接了這一挑戰。
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新加坡分子與細胞生物學研究所的陳譚 (Chris Tan) 指出,河豚基因組的測序將使人類基因庫的估計更加準確。他補充說,“我們現在也能夠改進許多非編碼區域的特徵,這些特徵可能被證明對人類基因組中表達的基因具有調控控制作用。”
