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所有不得不清理自家愛犬糞便的狗主人都知道，不僅僅是人類會經歷胃腸道疾病。許多動物，包括人類最好的朋友，也會遭受短暫和慢性的消化問題。因此，一些獸醫已經開始開出含有有益菌或“益生菌”的補充劑，以緩解腹瀉、嘔吐、脹氣和腹脹等相關症狀。但一些動物專家表示，幾乎沒有確鑿的證據表明這些補充劑有效。
根據佛羅里達大學獸醫學院小動物內科醫生和臨床營養學家Richard Hill的說法，胃腸道 (GI) 問題是犬類第二常見的健康問題，僅次於皮膚病。他指出，常見原因包括鉤蟲、鞭蟲和賈第鞭毛蟲等寄生蟲，以及“飲食不當”，這可能意味著從狼吞虎嚥地吃餐桌殘羹剩飯到喝馬桶裡的水，再到翻垃圾。
田納西大學獸醫學院營養學家Susan Wynn表示，犬類也可能患有慢性腹瀉，其根源在於細菌失衡或感染，如沙門氏菌、彎曲桿菌或大腸桿菌。
為了解決急性和慢性胃腸道疾病，一些獸醫現在轉向補充益生菌，即腸道內“有益細菌”，它們可能有助於消化，並幫助動物和人類抵禦胃腸道疾病。Wynn說，有證據表明益生菌有助於預防雞、豬和其他農場動物的感染，但沒有“確鑿的臨床證據”表明它們對狗也有效。但她指出，初步研究表明，它們也可能對幼犬有益。
據愛爾蘭科克大學學院Alimentary Pharmabiotic Center的免疫學家Liam O'Mahony稱，總部位於辛辛那提的寶潔公司生產一種名為Prostora Max的軟嚼益生菌補充劑，其中含有一種特殊的動物雙歧桿菌菌株，該菌株在實驗室研究中可以殺死引起疾病的細菌沙門氏菌和艱難梭菌。O'Mahony領導了發現和分離該菌株的團隊，他說一項尚未發表的臨床研究結果表明，該細菌有助於清除各種犬種的腹瀉。
最近的研究包括31只患有腹瀉的狗——10只德國牧羊犬、11只拉布拉多尋回犬、2只金毛尋回犬和8只拉布拉多-金毛尋回犬混血犬。接受益生菌的13只狗的恢復速度比其他動物快約40%——4天而不是7天。原因是什麼？Mahoney推測，有益細菌會勝過那些導致胃腸道不適的細菌，或者益生菌可能會以某種方式增強腸道屏障。
與此同時，普瑞納開發了一種名為Fortiflora的產品，其中含有屎腸球菌，該公司聲稱該產品可以增強狗狗的免疫反應。一些研究表明，服用屎腸球菌會導致血液中某些抗體（對抗病原體的蛋白質）濃度升高。
Hill說：“越來越多的證據表明益生菌確實能發揮作用。” 但在目前這個階段，“問題和答案一樣多。”