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使細菌產生耐藥性的 DNA 可能越來越多地汙染水源，從河流一直到水龍頭。科學家警告說，如果不清除這些汙染物，可能會加劇潛在有害微生物日益增長的耐藥性問題。這些基因加入了一長串在水中發現的汙染物名單，對設計有效的處理方法提出了挑戰。
目前，世界衛生組織報告稱，在美國每年有超過 200 萬人感染耐藥菌，其中 14,000 人因此死亡。細菌耐藥性的上升與人類和動物中藥物的廣泛使用有關。高達 95% 的抗生素以未改變的形式排出體外，滲入環境，並可能在那裡促進抗生素耐藥性。