今天正式公佈了一項大型公私合作倡議的提案,該提案旨在從頭開始合成整個人類基因組——這項工作可能需要十年時間,並且需要數十億美元用於技術開發。此前,該提案在一個秘密會議上首次提出,一個月後正式公佈。
該專案名為“人類基因組計劃-寫入”(HGP-write),其支持者在《科學》雜誌上撰文稱,來自各種資金來源的1億美元將有助於啟動他們的願景。該團隊由紐約大學的合成生物學家傑夫·博克、波士頓哈佛醫學院的基因組科學家喬治·丘奇以及加利福尼亞州聖拉斐爾市商業設計工作室Autodesk Research的未來學家安德魯·赫塞爾領導。
但這一想法(主要旨在開發降低DNA合成成本的技術)並未在研究人員中獲得普遍的興奮。
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對一些人來說,該提案因其雄心壯志和十足的魄力而值得稱讚:目前,只有微小的細菌基因組和部分麵包酵母基因組是從頭開始合成的。但其他研究人員告訴《自然》雜誌,他們認為HGP-write是對已經在降低DNA鏈合成價格的公司中進行的工作的不必要集中化。 HGP-write的一些支持者在這些公司(包括馬薩諸塞州劍橋市的Gen9)中持有財務權益。
“我的第一個想法是‘那又怎樣’,”蘇黎世瑞士聯邦理工學院的合成生物學家馬丁·富森格說。“我個人認為這會自然發生。最終只是價格問題。”
還有一些人認為,該專案應該推遲,直到其領導者能夠為合成人類基因組的想法贏得更廣泛的支援。加利福尼亞州斯坦福大學的合成生物學家德魯·恩迪和伊利諾伊州埃文斯頓西北大學的宗教學者勞裡·佐洛斯在一封傳送給記者的電子郵件中表示,HGP-write團隊沒有充分證明他們的目標是合理的,並且該專案應該被放棄。“我們仍在等待廣泛人群參與的嚴肅的公眾辯論,”他們寫道。
秘密啟動
在5月份,當HGP-write在哈佛大學一個僅限邀請的會議上提出時,恩迪和佐洛斯就已經質疑了合成人類基因組的科學原理。該會議有100多位科學家、企業家、律師和倫理學家參加。該會議的封閉性質也招致了批評:丘奇告訴《Stat》,這是因為描述該工作的論文正在保密中。
“那天對於發生了什麼有很多困惑,”參加會議的倫敦帝國學院的合成生物學家湯姆·埃利斯說。“有些人瞭解[論文的]審查過程,而另一些人則試圖找出答案。”
今天關於HGP-write的三頁公告補充了一些細節。它指出,當前的技術既過於昂貴又過於原始,無法合成30億個鹼基對的人類基因組。該團隊呼籲進行一系列試點專案,例如合成更短的基因組片段和製造精簡的染色體以執行特定任務,以使最終目標可行。他們說,整個專案應該需要不到30億美元(公共資助的人類基因組計劃的價格)。
參加會議的倫敦帝國學院的合成生物學家保羅·弗裡蒙特說:“我認為這是一個很棒的專案。”“如果你想這樣做,它將與人類基因組計劃的規模相同,它將需要一些大型資助機構和世界各地的數百名研究人員。”
埃利斯和其他人擔心,一個明確專注於構建人類基因組合成版本的中心化專案(而不是多種基因組)可能會不必要地縮小該專案的成果。但是,博克(他在2014年報告了合成27萬個DNA字母的酵母染色體)不理會這一反對意見。他說,他設想HGP-write最終將產生來自小鼠、微生物和人類以外的各種生物的合成基因組。
加利福尼亞大學伯克利分校的生物化學工程師丹妮爾·圖爾曼-埃爾塞克補充說:“有形產品可能最初進展緩慢,但以更低的成本大規模編寫DNA將使研究人員的工作效率更高,更全面,從而為間接產品帶來無限的潛力。”
基因組編寫的障礙
更便宜的DNA合成並不是編寫人類基因組的唯一障礙。埃利斯說,目前沒有方法可以將非常大的DNA片段插入哺乳動物細胞並使其正常工作,而研究人員對於如何設計一個複雜的基因組,使其對現有基因組進行微小的改變也知之甚少。
弗裡蒙特擔心,諸如DNA合成公司之類的商業利益可能會對該專案提出要求。“我認為,如果這是一個開放的、公共資助的倡議,那將是很好的,”他說。
博克說,他希望HGP-write的成果不存在智慧財產權限制,就像他的合成酵母基因組專案一樣。但是他說,“很有可能”參與HGP-write的公司將被授予此類權利,“以完成這項工作”。為了允許更廣泛的訪問,博克說,該專案可能會建立專利池,以允許使用者輕鬆許可該專案的成果。
在他們的《科學》雜誌文章中,HGP-write團隊表示,他們將在開始工作之前尋求更廣泛的公眾支援。博克說,哈佛會議的大部分內容都集中在該專案的倫理方面。
他說,合成細胞將被設計為無法繁殖。“我們不是在試圖製造一支克隆軍隊或開啟優生學的新時代。這不是計劃。”
本文經許可轉載,並於2016年6月2日首次發表。
