化學家表示,他們透過證明 RNA 分子可以將氨基酸短鏈連線在一起,從而解決了生命起源理論中的一個關鍵問題。
這些 5 月 11 日發表在《自然》雜誌上的發現,支援了“RNA 世界”假說的一種變體,該假說提出,在 DNA 及其編碼蛋白質進化之前,最早的生物是基於 RNA 鏈的,RNA 分子既可以儲存遺傳資訊(以核苷 A、C、G 和 U 的序列形式),又可以作為化學反應的催化劑。
德國杜塞爾多夫海因裡希·海涅大學研究分子進化的 Bill Martin 說,這一發現“為早期化學進化開闢了廣闊而全新的研究途徑”。
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標準的“RNA 世界”理論認為,生命可能以複雜的原始 RNA 鏈的形式存在,這些 RNA 鏈既能自我複製,又能與其他鏈競爭。 後來,這些“RNA 酶”可能進化出構建蛋白質的能力,並最終將其遺傳資訊轉移到更穩定的 DNA 中。 這種情況究竟是如何發生的仍然是一個懸而未決的問題,部分原因是僅由 RNA 製成的催化劑遠不如當今所有活細胞中發現的基於蛋白質的酶有效。“儘管[RNA]催化劑已被發現,但它們的催化能力很差,”德國慕尼黑路德維希·馬克西米利安大學的有機化學家 Thomas Carell 說。
RNA 核糖體
在研究這個難題時,Carell 和他的合作者受到了 RNA 在所有現代生物體構建蛋白質的方式中所起作用的啟發:編碼基因的 RNA 鏈(通常從 DNA 鹼基序列複製而來)透過一個叫做核糖體的大型分子機器,該機器一次構建一個氨基酸的相應蛋白質。
與大多數酶不同,核糖體本身不僅由蛋白質組成,還由 RNA 片段組成——這些片段在蛋白質合成中起著重要作用。 此外,核糖體包含標準 RNA 核苷 A、C、G 和 U 的修飾版本。這些奇異的核苷長期以來一直被認為是原始湯的可能遺蹟。
Carell 的團隊構建了一個合成 RNA 分子,該分子透過連線在活細胞中常見的兩段 RNA,包含了兩個這樣的修飾核苷。 在第一個奇異位點,合成分子可以與一個氨基酸結合,然後側向移動,與相鄰的第二個奇異核苷結合。 然後,該團隊分離了他們原始的 RNA 鏈,並引入了一個新的 RNA 鏈,該鏈攜帶了自己的氨基酸。 這位於正確的位置,可以與先前連線到第二條鏈的氨基酸形成強大的共價鍵。 該過程一步一步地繼續,生長出一條氨基酸短鏈——一種叫做肽的微型蛋白質——它附著在 RNA 上生長。 氨基酸之間鍵的形成需要能量,研究人員透過用溶液中的各種反應物引發氨基酸來提供能量。
Martin 說:“這是一個非常令人興奮的發現,不僅因為它描繪了一條基於 RNA 的肽形成的新途徑,而且因為它還揭示了 RNA 天然存在的修飾鹼基的新進化意義。” Martin 補充說,結果表明 RNA 在生命起源中發揮了重要作用,但不需要 RNA 單獨自我複製。
亞特蘭大佐治亞理工學院的生物物理化學家 Loren Williams 對此表示贊同。 他說:“如果 RNA 的起源和蛋白質的起源是相關的,並且它們的出現不是獨立的,那麼數學計算就會發生根本性的轉變,有利於 RNA-蛋白質世界,而遠離 RNA 世界。”
為了證明這是生命起源的一種合理可能性,科學家們必須完成幾個進一步的步驟。 該團隊 RNA 上形成的肽由氨基酸的隨機序列組成,而不是由儲存在 RNA 中的資訊決定的序列。 Carell 說,更大的 RNA 結構可能具有摺疊成特定形狀的部分,這些形狀可以“識別”特定位點的特定氨基酸,從而產生結構明確的結構。 其中一些複雜的 RNA-肽雜合物可能具有催化特性,並受到進化壓力,變得更有效率。 “如果分子可以複製,你就擁有了類似迷你生物的東西,”Carell 說。
本文經許可轉載,首次發表於 2022 年 5 月 11 日。
