在細菌的凝膠狀基質深處,存在著被稱為逆轉錄子的微小“細胞機器”,它們產生單鏈DNA來檢測某些病毒感染。現在,研究人員首次使用這些天然的DNA指令碼編寫器來修改人類細胞中的基因。一項新的研究,發表於《自然-化學生物學》,表明這項技術可以增強不同動物群體的基因編輯。
儘管廣為人知的 CRISPR 過程在近年使基因編輯變得容易得多,但該研究的資深作者,加州大學舊金山分校的生物工程師 Seth Shipman 說,它“有其自身的侷限性”。這個過程引入一種名為 Cas9 的酶來切割 DNA 片段,並提供研究人員設計的所需 DNA 模板,供細胞在修復過程中整合。但是,這種模板 DNA 是在實驗室中建立的,必須與 CRISPR 的元件分開插入——而且它並不總是能穿透細胞膜。
Shipman 和他的同事轉而使用逆轉錄子在細胞內部製造 DNA,CRISPR 過程可以很容易地利用它。逆轉錄子攜帶一種名為逆轉錄酶的酶,它可以根據 RNA 構建 DNA 鏈。加州大學舊金山分校的研究生和該研究的主要作者 Santiago Lopez 說,它們還具有“一些奇怪的 RNA 重疊環”,這有助於它們發揮功能。
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研究人員在實驗室中改造了逆轉錄子,使其產生所需的模板 DNA。此外,他們延長了 RNA 環,這一改變結果表明可以讓每個逆轉錄子產生更多的 DNA 副本。最後,他們將逆轉錄子與 CRISPR 的元件一起插入細胞中。
使用這個過程,逆轉錄子在酵母細胞中產生的模板 DNA 比在人類細胞中多 10 到 100 倍。逆轉錄子在酵母中的編輯精度也比在人類細胞中更高,這可能是由於鏈的數量不同,或是每種細胞型別修復 DNA 的方式不同。“但坦率地說,我們現在並不太擔心,”Shipman 說,“因為這僅僅是邁出了一步。” 他說,更多的調整和最佳化可能會在人類細胞中產生高度精確的編輯。
內布拉斯加大學分子生物學家 Channabasavaiah B. Gurumurthy 說:“如果我們能夠將逆轉錄子重新用於在患者細胞內產生 DNA 作為‘供體’,那麼它可以用於基因治療應用,治療諸如鐮狀細胞貧血症等疾病,這些疾病只需要修復小段的缺陷基因序列。”他沒有參與這項研究。
韓國 IBS 基因組工程中心主任金進洙(Jin-Soo Kim)說,但將外源 DNA 引入人體組織細胞也可能“引起限制基因修飾的不良免疫反應”,他也沒有參與這項工作。金補充說,單獨使用 CRISPR 的研究人員已經開發出抑制這種反應的過程,但如何適應逆轉錄子仍有待觀察。
