巴西國家博物館的工作人員和科學家們在他們舊建築空蕩蕩的外殼附近，以及其富含歷史的藏品化為灰燼的情況下，於週三上午舉行了自週日火災以來的首次會議，開始拼湊未來——一個突然失去了大量巴西自然和文化遺產的未來，這些遺產是探險家和研究人員在該博物館200年曆史中收集和儲存的。
火災中沒有人死亡或受傷——考慮到工作人員在建築物內部零件在他們周圍坍塌時，最後時刻努力搶救標本和裝置，這令人震驚。但一位博物館官員估計，該機構最初2000萬件標本中，可能有高達1800萬件在週日晚上大樓關閉後不久開始的熊熊大火中被毀。在失蹤且推定丟失的獨特物品中，包括已消失部落語言的唯一錄音，以及來自某些情況下已不復存在的地方的已滅絕動植物的唯一標本。
博物館館長亞歷山大·凱爾納告訴《大眾科學》，與巴西國會、內閣成員和總統米歇爾·特梅爾的會議已確保立即撥款240萬美元，用於穩定博物館在里約熱內盧北部公園內的被毀外殼，“並恢復可以恢復的東西”。這必然是一個緩慢的過程。例如，一些古生物學標本可能在稱為壓縮機的重型儲存容器中倖存下來。但是這些壓縮機現在被燒焦並覆蓋著瓦礫——瓦礫本身也需要被仔細檢查，以尋找從上層掉落的其他藏品的殘餘物。凱爾納說，正在討論額外撥款120萬美元，“使建築物適宜居住”。除此之外，“我們正在討論明年”再撥款1920萬美元重建博物館結構的可能性，該博物館最初是19世紀早期的宮殿。
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但這些討論正在進行之際，巴西總統競選活動即將進入最後階段，屆時政治家們更容易做出承諾和指責。特梅爾在推特上稱巴西曆史和文化的損失是“不可彌補的”，並且是“所有巴西人悲傷的一天”。然而，批評人士立即指出，特梅爾的右翼政府已大幅削減科學和教育的聯邦 funding，作為緊縮計劃的一部分。其他人反駁說，他只是加深了他的左翼前任開始的削減。無論如何，國家博物館的預算已驟降至僅為五年前的不到五分之一，工作人員有時不得不求助於眾籌來維持展覽向公眾開放。
在一次電視採訪中，當建築物仍在身後冒煙時，博物館副館長路易斯·費爾南多·迪亞斯·杜阿爾特指出，政府在體育場館上花費巨資以舉辦2014年世界盃。“花在每個體育場館上的錢——四分之一就足以使這座博物館安全而輝煌，”他說。昆蟲學家史蒂夫·林加費爾特（Steve Lingafelter）是一位現已從史密森尼國家自然歷史博物館退休的昆蟲學家，他曾在巴西博物館存放過標本，他重複著一個令人痛苦的謠言，“巴西政府高階官員的車隊清潔預算實際上超過了[國家博物館]的安全和維護預算。”
調查人員尚未確定火災原因，儘管政府官員表示，可能是電氣線路故障。在巴西，人們也經常燃放火驅動的紙氣球作為慶祝儀式，其中一個可能落在了建築物的屋頂上。政府的開發銀行最近承諾花費約 500 萬美元用於博物館的翻新計劃，包括消防——但在火災爆發時，尚未安裝此類系統。（凱爾納表示，這些資金將繼續用於重建計劃。）
週日晚上被召到現場的消防員努力減緩火勢蔓延，因為附近的消防栓是乾的。他們最終從公園的湖泊中取水。與此同時，博物館工作人員破門而入，進入火災尚未蔓延到的區域的藏品室，搶救標本和裝置。博物館魚類學家保羅·安德烈亞斯·巴克普與一位技術人員一起進入燃燒的主樓，該技術人員知道軟體動物部門最重要標本的位置——也就是軟體動物——他們開始一抽屜一抽屜地搬運出來。“其他人也在甲殼類動物實驗室做同樣的事情，”巴克普說。“我們可以感覺到煙霧，我們所擁有的一點光線都來自外面肆虐的火焰。”但這項努力很快結束了，因為碎片從建築物的松木內部掉落下來，巴克普將其描述為“火絨”。
博物館的植物學和脊椎動物生物學部門、教室和一些無脊椎動物藏品在獨立的現代化建築中倖存下來。即使在主樓內，許多礦物學和古生物學標本也可能經受住了火焰。但據巴克普稱，人類學藏品和大部分昆蟲學幾乎肯定丟失了，而大量人類學和自然歷史圖書館現在可能只以數字化形式存在。露西亞婦女，一個被認為是南美洲發現的最古老的人類遺骸之一的11,500年前的部分骨骼，可能也丟失了。
在 Facebook 和 Twitter 上，全球的研究人員也開始統計科學的損失。林加費爾特將巴西博物館的 cerambycid（或長角）甲蟲收藏描述為“世界上最好的收藏之一”。他寫道，該收藏包括 1,000 多個模式標本——物種永遠由此定義的標本——“以及數十萬個標本。我非常瞭解那裡的館長，我的心為他們而碎。”
抗議者——其中一些人淚流滿面——週一聚集在博物館廢墟外，許多人將這次損失視為政府腐敗和經濟政策的象徵，批評人士稱這些政策最近摧毀了巴西的文化和教育機構、醫療保健系統及其基礎設施。“他們正在焚燒我們的歷史，他們正在焚燒我們的夢想，”一位高中教師告訴《紐約時報》。
對於全球自然歷史博物館界來說，這次損失也象徵著近幾十年來一直危及其工作的長期資金不足。當一場大火在 1978 年摧毀葡萄牙自然歷史與科學博物館時，大量巴西標本消失了——隨後的火災在 2010 年和 2015 年損壞了其他巴西博物館的藏品。巴西國家博物館的損失也與 2016 年印度新德里國家自然歷史博物館的整個藏品被大火燒燬相呼應，該博物館是印度最大的動植物遺產聚集地。然而，即使在沒有這種災難性損失的情況下，缺乏工作人員和氣候和溼度控制系統等基本裝置也威脅著幾乎所有地方的藏品——這種情況導致期刊《自然》在 2015 年的一篇文章中擔憂，自然歷史藏品正變成“瀕危的逝者”。
“在這個時候，令人清醒地提醒我們，自然歷史很重要，”在週日火災發生後發表的聯合宣告中，世界 12 個最大的自然歷史博物館的館長宣佈。“自然歷史博物館記錄、保護和慶祝自然世界，”館長們說。“我們的藏品是地球生命瞬間的寶貴圖書館——每件人工製品和標本都是世界如何變成今天的樣子的關鍵記錄，也是我們如何在未來保護它的線索。”這封信還承諾館長們各自的博物館將重建巴西藏品。NMNH 館長柯克·約翰遜表示，那裡的館長們也在“為更大的史密森尼學會努力”。
在里約熱內盧，博物館工作人員呼籲附近的居民將火災後在設施花園的收集點發現的“檔案、書籍碎片”和其他物品帶到收集點。來自巴西博物館研究專案 UNIRIO 的學生也呼籲博物館參觀者傳送標本照片，並補充說，“如果運氣好的話，一些照片將帶有清晰的標籤，這可能有助於恢復至少一些資料。”（將照片透過電子郵件傳送至 thg.museo@gmail.com 或 lusantosmuseo@gmail.com 或 isabelasfreitas@gmail.com)
“目前，”巴克普說，“我們有足夠的資源來照顧眼前的需求。”這意味著為同事——90 名科學家、150 名技術人員和 500 名學生——在博物館倖存的部分中工作找到空間。“我們最需要的是巴西政府甚至私營企業做出強有力的承諾，為科學家恢復最低工作條件提供手段，”巴克普補充說。“我們失去了許多歷史。我們不能承受失去的是該機構的科學未來。”