分子尋寶遊戲

一款軟體工具透過梳理成千上萬篇期刊文章,挖掘出以前未被發現的基因或蛋白質通路

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1996年,安德烈·熱茨基作為研究科學家來到哥倫比亞大學時,他參與的第一個專案是文獻檢索,試圖瞭解為什麼稱為淋巴細胞的白細胞在慢性淋巴細胞白血病中不會死亡。這位數學家-生物學家找到了數百篇關於細胞凋亡(程式性細胞死亡)和癌症的文章。即使他將所有時間都投入到這項任務中,也不可能對所有已發表在期刊上的文獻進行全面的掃描。更糟糕的是,“這只是冰山一角,遠不足以理解整個過程,”他感嘆道。

這次經歷讓他產生了一個想法,這個想法本可以使他在第一個專案中的工作輕鬆得多:一個自動搜尋工具,可以取代令人麻木地查詢和閱讀所有文獻的任務。但這可能做得更多;它甚至可以讓機器自行進行研究,像人類一樣發現數據中的模式。

加里·斯蒂克斯,《大眾科學》雜誌心理與大腦主題的高階編輯,負責編輯和報道推動腦科學發展到生物科學前沿的新興進展。斯蒂克斯編輯或撰寫過封面故事、專題文章和關於各種主題的新聞,範圍從一個人沉浸在思考時大腦中發生的事情,到減輕抑鬱症等情緒障礙的腦植入技術的影響。在接手神經科學領域之前,斯蒂克斯作為《大眾科學》的特別專案編輯,負責雜誌的年度單主題特刊,構思和製作了關於阿爾伯特·愛因斯坦、查爾斯·達爾文、氣候變化和奈米技術的特刊。他負責的一個關於時間及其所有表現形式的特刊獲得了國家雜誌獎。斯蒂克斯與他的妻子米里亞姆·拉科布合著了一本名為《誰給千兆位元組?技術困惑者的生存指南》的技術入門書。

更多作者:加里·斯蒂克斯
大眾科學 Magazine Vol 292 Issue 5本文最初以“分子尋寶遊戲”為標題發表於《大眾科學》雜誌第292卷第5期(
doi:10.1038/scientificamerican052005-6svBDKACmMw496RzqSDPE5
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