關於現代人類與我們祖先之間是愛還是戰爭的問題，在幾十年常常充滿火藥味的辯論中搖擺不定。目前，大多數試圖從我們的基因組中解讀史前史的研究人員認為，我們不包含過去物種的任何痕跡，我們都起源於一個在過去 10 萬年內離開非洲的群體，並在沒有雜交的情況下取代了所有其他人種，如尼安德特人。
然而，那些贊成另一種觀點的人認為，問題正朝著他們希望的方向發展。亞利桑那大學的默裡·考克斯說：“一些不符合近期單一起源於非洲的遷徙模型的現象正在浮出水面。” 考克斯認為，他和他的同事們發現了迄今為止最清晰的跡象，表明現代人類與直立人發生了交配，直立人是一種起源於大約 200 萬年前的物種，許多人認為它在我們自身的譜系中佔有一席之地。
支援“全能非洲人”的論據主要基於對 Y 染色體和線粒體的研究，線粒體是細胞內產生能量的結構，它有自己的小型基因組，並透過母系遺傳。這些序列中的所有現代變異都追溯到非洲，並顯示出相對近期的共同祖先。（缺乏明顯的混合化石也支援了這一觀點。）
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但是，考克斯說，我們親屬的基因還有很多其他地方可以隱藏。透過研究現代人類種群的遺傳學，他和他的同事們偶然發現了一個 X 染色體區域，稱為RRM2P4，該區域顯示不同地方的人們之間存在巨大差異——這是古代基因分裂的跡象。為了確定該基因的起源，研究人員對大約 250 個人進行了測序，其中一半來自非洲，其餘來自中國、中亞、西南歐的巴斯克地區和太平洋島嶼。
研究人員將基因序列之間的差異轉化為它們分歧的日期，得出的結論是，RRM2P4 的各種形式最後一次共享共同祖先是在大約 200 萬年前——大約在直立人從非洲遷徙到亞洲的時候。而且最古老的變體似乎起源於亞洲，現在幾乎只在那裡發現。
考克斯認為，古老的年代和亞洲起源的結合是令人信服的。化石表明，直立人可能在亞洲存活到大約 3 萬年前，與現代人類重疊了大約 1.5 萬年。“這個基因最常見的地方正是你發現直立人化石的地方，”考克斯說，他在 1 月版的Genetics雜誌上描述了這一發現。該團隊還使用了新的統計技術來表明，該基因在亞洲而非非洲產生的可能性要大得多。可能性是
直立人和現代人類雜交更令人驚訝，他補充說，因為大多數研究人員認為沒有證據表明我們與親緣關係更近的尼安德特人交換過基因。
其他研究人員指出，許多因素都可能在人類群體之間造成深刻的基因分裂。沒有人否認我們基因組的絕大部分具有近期的非洲起源。但這種主導地位使得很難分辨少量與其他譜系雜交的遺產可能是什麼，以及可能只是巧合。斯坦福大學的遺傳學家彼得·安德希爾解釋說，在整個基因組中，即使某些群體大約在同一時間離開非洲，它們也會表現出很大的差異。“當你看到這些離群值時，它們真的是某些戲劇性事件的象徵，還是僅僅是正常分佈的極端值？對我來說，這仍然是一個懸而未決的問題，”他說。
或者，亞洲形式的 RRM2P4 可能存在於一個離開非洲但在非洲大陸後來滅絕的群體中。或者研究人員可能只是沒有觀察到足夠的非洲人來找到它；事實上，考克斯和他的同事認為來自 H. erectus 的 DNA 序列存在於一位非洲人中。英格蘭劍橋安格利亞魯斯金大學研究考古遺傳學的彼得·福斯特認為，這一發現表明亞洲RRM2P4可能起源於非洲。“在一個非洲人身上發現這種基因，大大破壞了這個故事，”他說，並補充說，“我不認為這是古代人類混合的令人信服的證據。”
考克斯反駁說，這位孤獨的非洲人的RRM2P4序列與亞洲群體相同，這表明這個人可能來自最近的亞洲移民。該團隊還獲得了關於第二個 DNA 區域的初步資料，該區域也顯示出同樣古老的分裂，其中一個群體似乎完全是亞洲的。
牛津大學的遺傳學家羅莎琳德·哈丁說，沒有一個基因可以解決這個問題。然而，一些研究表明，人類基因組記錄了一些驚人的種群間深刻分裂。例如，她的團隊發現，血紅蛋白基因的一部分似乎非常古老。如果古代序列的發現繼續堆積，考古遺傳學家最終可能會相信，我們所有人的血液中都有一點直立人的成分。