幹細胞科學因迫使社會重新考慮人類胚胎細胞和人類之間的界限而臭名昭著。鮮為人知的是，它也把我們推向了另一個可能令人驚訝地模糊的邊界：將人類與動物分開的邊界。幹細胞促進了高階種間嵌合體的產生——即人類和動物細胞的活體拼湊體。這種生物的存在所引發的倫理問題可能會變得非常令人擔憂。
在希臘神話中，嵌合體是一種結合了山羊、獅子和蛇部分的怪物。有了這樣一個同名，實驗室培育的嵌合體聽起來像是純粹科學傲慢的壞主意。然而，如果幹細胞要實現治療目的，它們可能是不可避免的。研究人員需要研究幹細胞在體內如何表現和對化學訊號做出反應。除非他們要在人體中進行這些有風險的首批實驗，否則他們將需要自由地在動物身上進行測試，從而製造出嵌合體。
斯坦福大學的歐文·韋斯曼及其同事在1988年開創了這些嵌合體實驗，當時他們創造了具有完全人類免疫系統的老鼠，用於研究艾滋病。後來，斯坦福小組和韋斯曼共同創立的StemCells公司還將人類幹細胞移植到新生小鼠的大腦中，作為神經研究的初步模型。此外，內華達大學雷諾分校的埃斯梅爾·扎賈尼與胎羊合作，創造了成人動物，其全身都融合了人類細胞。
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隨著動物體內人類細胞比例的增加，後果將如何，無人知曉。例如，韋斯曼和其他人設想有一天會製造出具有完全“人源化”腦組織的小鼠。這種嵌合鼠的律師發展計劃和微小體積相當保證了它的智力不會與正常小鼠有太大差異。但是，如果將人類細胞放入黑猩猩的胎兒中會怎樣？不能排除誕生不那麼像野獸的東西。
組織的混合也可能使傳染性動物疾病更容易傳播到人類身上。跨越物種屏障的疾病可能尤其具有破壞性，因為它們的新宿主的免疫系統對這些疾病毫無準備（1918年的流感大流行被廣泛認為是由禽流感病毒引起的）。
目前還沒有關於嵌合體實驗的國際標準。加拿大2004年的《輔助人類生殖法》禁止人獸嵌合體。美國沒有正式的限制，但堪薩斯州參議員薩姆·布朗巴克在3月份提出立法，將禁止幾種嵌合體，包括具有大量人類腦組織的嵌合體。一些提供人類幹細胞的機構對允許進行的實驗設定了自己的額外限制。
在美國，至少，美國國家科學院在4月下旬提出的關於幹細胞使用的一般指導方針可能會產生更大的統一性。美國國家科學院建議通常允許涉及大多數動物物種的嵌合體。它敦促禁止在其他靈長類動物中使用人類細胞，以及將動物細胞引入人類囊胚。它還警告不要允許人獸嵌合體繁殖：一些人類細胞可能已經設法滲透到動物的睪丸和卵巢。繁殖這些動物理論上可能會導致可怕的（並且在大多數情況下，肯定會致命的）結果，即人類胚胎在動物母親體內生長。