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根據近期American Journal of Human Genetics雜誌上發表的一項研究，聯覺並非像長期以來認為的那樣由單個基因引起，而是由多個基因引起。研究人員將這種神經系統疾病（其特徵是異常的感官體驗，例如聽到聲音時看到顏色 [參見 Vilayanur S. Ramachandran 和 Edward M. Hubbard 的“Hearing Colors, Tasting Shapes”；大眾科學 Mind，第 16 卷，第 3 期；2005 年]）與四個染色體上的區域聯絡起來。這些區域包括：先前與自閉症相關的基因，自閉症是另一種涉及大腦中過度連線的疾病。這並不意味著聯覺者是自閉症患者（反之亦然）。但這可能解釋了某些形式的自閉症中報告的類似聯覺的症狀。正在進行後續研究，以檢視聯覺在自閉症患者中是否更常見，並探索其他遺傳巧合，包括聯覺、閱讀障礙和完美回憶（非凡的記憶能力）之間可能的聯絡。