著名的“HeLa”人類細胞系基因組被測序

該細胞系的基因組源自一位名叫海瑞塔·拉克斯的患者身上提取的致命宮頸腫瘤,其基因組錯誤百出,引發了人們對其在研究中持續使用的質疑

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科研領域最著名的人類細胞的基因組已被解碼,結果卻一團糟。德國研究人員本週報告稱,HeLa細胞系的基因組序列源自一位名叫海瑞塔·拉克斯的患者身上提取的致命宮頸腫瘤。

HeLa細胞於1951年拉克斯去世後被建立,是首個在實驗室中生長良好的人類細胞系。 這些細胞為超過6萬篇研究論文、20世紀50年代脊髓灰質炎疫苗的開發以及最近一項名為ENCODE的國際基因組表徵計劃做出了貢獻。

先前的研究表明,HeLa細胞與許多腫瘤一樣,擁有異常的、充滿錯誤的基因組,其中許多染色體有一個或多個額外的副本。為了更仔細地觀察這些改變,由德國海德堡歐洲分子生物學實驗室的遺傳學家拉斯·施泰因梅茨領導的一個團隊對流行的“京都”版細胞系進行了測序,並將該序列與參考人類基因組的序列進行了比較。該團隊的研究結果發表在G3期刊上。


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施泰因梅茨的團隊證實,HeLa細胞包含大多數染色體的一個額外版本,其中一些染色體最多有五個副本。許多基因的重複程度甚至更高,有時存在四個、五個或六個副本,而不是通常的兩個。此外,11號染色體和幾個其他染色體的大片段像紙牌一樣被重新洗牌,徹底改變了基因的排列。

由於沒有拉克斯健康細胞或她原始腫瘤的基因組序列,因此很難追蹤這些改變的起源。施泰因梅茨指出,其他宮頸腫瘤在11號染色體上也存在大規模重排,因此HeLa細胞中的變化可能促成了拉克斯的腫瘤。

潛在用途
HeLa細胞在全球實驗室中複製了六十年,也積累了原始腫瘤 DNA 中不存在的錯誤。此外,並非所有 HeLa 細胞都是相同的,施泰因梅茨表示,繪製細胞的進化過程將會很有趣。

施泰因梅茨表示,無論其起源如何,這些基因變化都引發了人們對 HeLa 細胞作為人類細胞生物學模型廣泛使用的質疑。例如,他的團隊發現,由於基因重複,大約有 2000 個基因的表達水平高於正常人體組織。他表示,替代細胞系,例如從患者皮膚細胞產生的誘導多能幹細胞,可以更準確地瞭解人類生物學。

英國劍橋附近惠康桑格研究所的癌症生物學家馬修·加內特表示,HeLa 細胞可能有助於研究宮頸腫瘤生物學的某些方面,例如它們對癌症藥物的反應。近年來,許多宮頸腫瘤的基因組已被測序,因此應該有可能瞭解這些基因組與 HeLa 基因組的比較情況。

施泰因梅茨還指出,數千篇基於 HeLa 細胞的研究論文,以及 HeLa 資源(如基因改造細胞系和現在的基因組)意味著,即使 HeLa 細胞不是完美的人類生物學模型,實驗室也將繼續儲備這些細胞。 “在未來 10 年內,這些細胞不會過時,”他說。“我不確定 20 年後我們會怎麼樣。”

本文經《自然》雜誌許可轉載。該文章於 2013 年 3 月 15 日首次發表

Ewen Callaway is a senior reporter at Nature.

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