一項錯誤迫使研究人員撤回他們之前的宣告:整個非洲的人類都攜帶遺傳自歐亞移民的DNA。
本週,作者們釋出了一份說明,解釋了他們 2015 年 10 月在《科學》雜誌上發表的關於來自衣索比亞的一名 4500 年前男性基因組的研究論文中的錯誤——這是來自非洲的第一個完整的古代人類基因組。該男子以莫塔洞穴命名,他的遺骸在那裡被發現(關於最初的發現,請閱讀以下文章:“首個非洲古代基因組揭示了大規模的歐亞移民”)。
儘管第一批人類大約在 10 萬年前離開了非洲,但 2013 年發表的一項研究發現,大約在 3000 年前,一些人又返回了非洲;這種逆向遷徙在非洲基因組中留下了痕跡。
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在《科學》雜誌的論文中,研究人員證實了這一發現。該論文還表明,整個非洲大陸的人口仍然保留著來自中東農民的顯著血統,這些農民是逆向遷徙的幕後推手。東非的人口,包括居住在莫塔洞穴附近的衣索比亞高地人,攜帶的歐亞血統水平最高。但該團隊還在西非和中非的一個俾格米人部落(姆布蒂人)中發現了“迴流”遷徙的痕跡。
英國劍橋大學的人口遺傳學家,該研究的共同負責人安德里亞·馬尼卡表示,該團隊在得出結論認為迴流到達了西非和中非時犯了一個錯誤。“3000年前左右的運動僅限於東非,”他說。
不相容的軟體
馬尼卡說,當他的團隊將古代衣索比亞男性的遺傳變異與參考人類基因組中的遺傳變異進行比較時,發生了錯誤。所使用的兩個軟體包之間的不相容導致一些衣索比亞男性與歐洲人共享的變異(歐洲人的DNA構成了人類參考序列的大部分)從分析中被移除。這使得莫塔人看起來與現代歐洲人口的親緣關係比實際的要遠——反過來,這使得當代非洲人口看起來與歐洲人的親緣關係更近。馬尼卡說,研究人員確實有一個指令碼可以執行來協調這兩個軟體包,但有人忘記執行它了。
馬薩諸塞州波士頓哈佛醫學院的人口遺傳學家蓬圖斯·斯科格倫說,他對西非和中非族群多達6-7%的祖先來自歐亞移民的說法感到驚訝。但在從馬尼卡的團隊獲得莫塔人的基因組後,他和他的同事大衛·賴希進行了自己的比較,發現沒有證據表明該結論。他們通知了馬尼卡的團隊,後者隨後發現了處理錯誤。
“幾乎我們所有人都同意存在一些返回非洲的基因流動,而且這是進入東非的一次相當大的遷徙,”斯科格倫說。“但它沒有到達西非和中非,至少沒有以可檢測的方式到達。”該錯誤也破壞了論文最初的結論,即許多非洲人攜帶尼安德特人DNA(遺傳自與該群體雜交的歐亞人的祖先)。
斯科格倫稱讚這篇論文——“基因組本身就很棒”,他說——以及研究人員願意分享他們的資料併發布一份關於錯誤的快速說明:他們於 1 月 25 日線上釋出了該說明。當被要求確認《科學》雜誌是否以及何時會發布研究人員的更新時,《科學》雜誌的一位代表表示該期刊尚無法發表評論。
馬尼卡還不確定《科學》雜誌是否會更改論文的標題,即“古代衣索比亞基因組揭示了整個非洲大陸廣泛的歐亞混血”。但如果團隊早些時候發現這個錯誤,他說,“我確信我們會用不同的方式來措辭”。
本文經許可轉載,首次發表於 2016 年 1 月 29 日。
