部落格作者將化學反應置於可重複性檢驗之下

一個線上專案尋求眾包幫助,以重現化學家已發表的成果

來自《自然》雜誌

一群化學部落格作者在業餘時間四處搜尋化學品和裝置,試圖複製已發表的分子製備方案。研究人員希望檢驗科學家在論文中報告的“配方”是否容易重複,並邀請其他化學家加入他們。

“我們只是一群想讓反應成功的人,”博主See Arr Oh解釋道,他常駐美國,但不願透露真名。其他團隊成員包括來自新澤西州普林斯頓的化學研究生馬特·卡徹,以及兩位名為Organometallica和BRSM的博主,他們共同推出了Blog Syn,並在其中線上報告他們的進展。 


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See Arr Oh表示,他和其​​他人對化學文獻感到沮喪的原因之一是,有些聲稱反應產生的產物量似乎超過了合理範圍,並且關於進行反應的具體條件的細節也很少。在某些情況下,報告的反應似乎好得令人難以置信——例如,一篇2009年的論文在網路技術嫻熟的化學家對實驗進行直播部落格後在24小時內被更正;這一事件部分啟發了Blog Syn。“我永遠不會忘記那個反應,”See Arr Oh補充道。 

英國考文垂華威大學的化學家彼得·斯科特說:“問問任何合成化學家,他們把大部分時間花在做什麼上,他們都會承認是在讓文獻中的反應起作用。” “這就是合成化學中顯而易見卻避而不談的問題。”

Blog Syn是化學家可以檢查合成技術的幾個平臺之一。例如,《有機合成》雜誌只發表經過其編輯委員會成員檢查和驗證過的合成程式。斯科特參與了另一個專案,旨在彙編一個包含約5000個化學程式的資料庫,名為SyntheticPages,它是ChemSpider的一部分,ChemSpider是一個線上化學結構資料庫。並且《視覺化實驗雜誌》(JoVE)——一個同行評審的線上期刊,釋出實驗影片——將於2月4日推出一個化學頻道。這可能有助於解決一些化學家面臨的一個難題:已發表的化學反應是以一種標準格式編寫的,這種格式本應使事物易於理解,但實際上往往需要一些不成文的調整才能使實驗成功。

See Arr Oh表示,Blog Syn與JoVE和SyntheticPages不同,因為後者的倡議涉及化學家改進和驗證他們自己的化學反應。相比之下,Blog Syn打算使用眾包,這意味著外部人員——首先是博主已經認識的化學家——將檢查其他人已經發表的工作。

案例測試
到目前為止,博主們已經研究了一個反應,他們選擇這個反應是因為如果它易於複製,將會特別有用;它使用鐵和硫催化劑來製造含有氧和氮的環狀分子。按照已發表的方法,該團隊無法獲得像原作者那樣多的最終產物。“它確實有效,但我們還不確定作者擁有哪些我們沒有的因素,”See Arr Oh說。該團隊的博文稱,一個問題是,書面論文沒有明確說明他們需要多麼嚴格地將空氣從反應中排除。

化學家們的線上努力反映了整個科學界越來越關注能夠重現已發表程式的重要性。一個專案,可重複性倡議,去年成立,旨在使研究人員能夠讓外部檢查員“驗證”他們的研究。另一個專案,可重複性專案,致力於評估心理學實驗的可重複性。該專案的主任,弗吉尼亞大學夏洛茨維爾分校的社會心理學家布賴恩·諾塞克認為,只有當化學家因參與而獲得獎勵時,Blog Syn才能發揮作用。

See Arr Oh承認,為Blog Syn提供資金將是在更大規模上發展它的挑戰。他正在探索使部落格更易於管理的方法,包括眾包資助方法,如Kickstarter網站。在此之前,他將繼續在業餘時間檢查反應。“目前,這些反應是在夜間秘密進行的,”他說。

本文經《自然》雜誌許可轉載。這篇文章於2013年1月21日首次發表

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