許多行業對候任總統唐納德·特朗普選擇俄克拉荷馬州總檢察長斯科特·普魯伊特擔任美國環境保護署署長感到高興。普魯伊特是共和黨反對清潔能源計劃的領軍人物。但有一個行業集團——乙醇生產商——正在關注普魯伊特過去在另一個備受爭議的環保署問題上與特朗普的分歧：該法律強制使用以作物為基礎的汽油新增劑。
可再生燃料標準（RFS）計劃，由時任總統喬治·W·布什於 2007 年簽署成為法律，要求能源公司將乙醇和生物柴油混合到汽油和柴油燃料中，以減少溫室氣體排放並減少對石油進口的依賴，同時幫助農村農民。玉米種植者及其盟友一直努力爭取儘可能多地將生物燃料混合到燃料中，但石油行業抱怨說，該計劃推高了成本，應予以廢除。
作為總檢察長，普魯伊特在 2013 年向美國最高法院提交了一份法庭之友簡報，他在其中辯稱環保署忽視了汽油中乙醇含量超過 10% 可能對汽車燃油系統造成的風險，以及 RFS 要求對食品價格的可能影響。“有明確的證據表明，目前的乙醇燃料強制要求是行不通的，”普魯伊特當時在一份宣告中表示。
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普魯伊特可能會迅速採取行動，結束奧巴馬政府的清潔能源計劃，該計劃要求大幅削減燃煤電廠的二氧化碳排放量。該計劃本應在今年生效，但遭到普魯伊特和 26 個州的一組團體提起的訴訟的阻止。然而，乙醇倡導者似乎並不擔心普魯伊特會在他們的問題上掀起類似的波瀾，因為特朗普和其他人顯然支援生物燃料。事實上，一位能源專家表示，從長遠來看，普魯伊特實際上可能能夠幫助 RFS 計劃擺脫長期困擾它的農業與石油衝突。
與許多共和黨人不喜歡其他最近的環境政策的情況不同，特朗普無法透過國會審查法案推翻清潔能源計劃，這是一項強大的 1996 年法律，允許國會在 60 個立法日內推翻機構行動（而無需參議院像幾乎所有立法一樣需要 60 票反對）。美國哥倫比亞特區巡迴上訴法院在 9 月份聽取了關於清潔能源計劃挑戰的辯論，預計將於明年某個時候釋出意見。
如果法院在特朗普就職典禮前未就暫停清潔能源計劃做出裁決，他的政府可能會要求法院釋出“自願發回”——根據該程式，由普魯伊特領導的環保署可以返回並修改發電廠排放規則，以解決行業對該計劃相當於政府大規模越權的擔憂。然後，該計劃的新版本將透過正式的環保署規則制定程式，該機構必須證明其立場與奧巴馬時代相比發生了變化。“各機構被允許改變主意，經常這樣做，並且至少在理論上，在制定規則時會受到法院的相同尊重，”保護組織未來資源公司的客座研究員內森·理查森在最近的部落格文章中寫道。“特朗普環保署必須承認立場的改變並提供理由，但法院會尊重該機構的技術判斷和（在一定程度上）對法律的解讀。這個新的 [環保署] 規則制定過程將需要數月，甚至數年。”
如果巡迴法院裁決反對清潔能源計劃，特朗普可以拒絕就該裁決向最高法院上訴——儘管環保組織和其他相關方可能會這樣做。“如果，在案件到達最高法院時，有一位特朗普任命的法官坐在上面，那麼[目前的清潔能源計劃規則]在那裡生存的機率不會讓人感到有信心，”哥倫比亞法學院的環境法教授、薩賓氣候變化法律中心主任邁克爾·傑拉德說。
本週，針對普魯伊特被提名為環保署署長，美國乙醇聯盟執行副總裁布萊恩·詹寧斯告訴一家行業刊物，他對總檢察長批評 RFS 的言論感到“失望”，並且普魯伊特的記錄“令人擔憂”。然而，詹寧斯還指出，特朗普曾公開表示支援乙醇，因為它符合候任總統實現能源獨立的政策主題（儘管特朗普也聽取了一些對 RFS 某些部分持批評態度的強大石油行業的聲音）。
詹寧斯預測，參議員將在確認過程中“有力地教育”普魯伊特——資深參議員查克·格拉斯利（共和黨-愛荷華州）也已承諾這樣做。“我期待與候任總統及其提名人合作，繼續國內生物燃料的成功，”格拉斯利告訴《大眾科學》，他的玉米生產關鍵初選州對 RFS 尤其看好。“如果需要，我將很樂意解釋生物燃料對美國經濟和國家安全、能源獨立和美國就業增長的諸多好處。”
即將離任的美國農業部長湯姆·維爾薩克，也是愛荷華州人，最近預測，考慮到農村州為支援 RFS 而建立的就業和基礎設施，廢除 RFS 將“非常困難”。“可再生燃料標準是堅實的，”他 11 月在告訴Bloomberg.com時表示。
RFS 要求環保署進行年度規則制定會議，以設定可再生燃料使用的要求。該機構已最終確定 2017 年的要求，這些要求將於 1 月 1 日生效。“要倒退是非常困難的——他們首先需要撤回並重新提出，並且在一切都得到解決之前，這一年將或多或少地結束，”哈佛大學經濟學教授詹姆斯·斯托克說，他曾於 2013 年 2 月至 2014 年 7 月在白宮經濟顧問委員會任職。
斯托克說，農業和石油利益集團之間關於乙醇的辯論毫無必要地造成了分裂，普魯伊特領導下的環保署應該將重點轉向“第二代”生物燃料，這種燃料不會引起如此激烈的爭鬥。他特別指出，特朗普政府現在有機會更加重視纖維素乙醇，這種乙醇由草、木材、藻類和其他在國內種植和提煉的較少傳統的燃料植物生產。石油行業一直抵制利用 RFS 推廣這些第二代燃料的嘗試，擔心它們可能會與自身的產品競爭。但斯托克指出，布什在 2006 年呼籲促進技術發展，使纖維素乙醇在六年內與玉米基乙醇競爭。他說，擁抱早期的“共和黨願景”符合特朗普在農村美國創造更多就業機會，同時增強能源安全的目標——並且它還將降低碳排放。