今天，隨著總部位於加利福尼亞州卡爾斯巴德的Life Technologies公司宣佈，它將在今年推出一種新型測序儀，該測序儀最終將能夠在一日之內以低於1000美元的價格解碼整個人類基因組，從而使1000美元基因組的競賽升溫。這款名為Ion Proton的機器，將是該公司旗下子公司Ion Torrent生產的個人基因組測序儀的升級版。
為了不甘示弱，目前市場領導者、總部位於加利福尼亞州聖地亞哥的Illumina公司表示，它將在今年下半年釋出自己的一天內完成基因組測序的競爭者，HiSeq 2500。 與要求客戶購買全新機器的Life Technologies不同，Illumina表示，它將能夠以相對較低的價格升級現有客戶的HiSeq 2000機器。
那麼，這場測序儀之戰將如何發展呢？
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Ion Torrent將其新機器定位為Illumina售價69萬美元的HiSeq的低成本替代品。科學家們似乎願意相信Ion Proton將實現其速度目標，這主要是因為Ion Torrent目前的型號，即個人基因組測序儀，在客戶中的表現良好。這使得Ion Torrent與其他無法在其第一代模型上交付成果的新技術公司區分開來，例如加利福尼亞州門洛帕克的Pacific Biosciences公司，該公司上週更換了執行長，並且陷入了財務和法律問題，以及總部位於馬薩諸塞州劍橋的Helicos公司，該公司繼續在需求不振的情況下苦苦掙扎。
SeqAnswers.com論壇上的這篇文章計算得出，2012年中期與Ion Proton一起釋出的第一款測序晶片Proton 1將能夠對三到六個人類外顯子組進行測序，外顯子組是基因組的基因編碼部分。Life Technologies表示，今年年底與該機器一起釋出的第二款測序晶片Proton II將包含足夠的感測器來測序整個基因組。Life Technologies正在將Ion Proton定位為進入臨床診斷測序市場，並計劃今年向美國食品和藥物管理局申請批准將該機器用作醫療裝置。到目前為止，Illumina已經佔據了大部分小而增長的臨床測序市場。
但是科學家們不太相信使用Ion Proton測序人類基因組的成本將低於1000美元，或者執行成本會低於HiSeq。研究人員指出，目前，使用個人基因組測序儀測序人類基因組將花費數萬美元。Life Technologies告訴我，Ion Proton的1000美元人類基因組估算包括執行的測序晶片和試劑的成本，但是高盛分析師Isaac Ro在一份研究報告中指出，Proton II晶片本身將花費1000美元，因此尚不清楚Life Technologies是如何得出1000美元這個數字的。
Ion Proton機器的成本相對較低，為149000美元，因此即使客戶根據Ro的說法，還必須額外支付95000美元用於伺服器和自動化樣品製備裝置，但他指出“價格點顯然是同類產品中最好的，而且優勢明顯”。
但是Illumina提供以相當低的50000美元的價格將其現有客戶升級到HiSeq 2500，因此他們可能沒有太大的動力投資新的Ion Proton機器，特別是考慮到他們已經知道Illumina的技術非常準確，並且測序業務已經受到當前財政緊縮環境的影響。Life Technologies在釋出個人基因組測序儀僅僅一年後就宣佈推出新裝置，似乎也惹惱了一些現有客戶：“如此早地宣佈一個PGM殺手真的是明智之舉嗎？” 尼克·洛曼在病原體：基因和基因組部落格中問道。
儘管如此，在Ion Torrent平臺中，Life Technologies終於找到了一種可以與Illumina競爭的方式，這是迄今為止其他任何公司都無法做到的，而且這種競爭只能對客戶有利。隨著大量其他測序技術處於不同的開發階段，這些公告預示著新測序技術激動人心的一年即將開始。
此部落格文章經《自然》雜誌許可轉載。該文章於2012年1月10日首次發表。