在我們這個化石燃料時代,石油洩漏仍然是一個主要問題。從“埃克森·瓦爾迪茲”號到最近西班牙的“威望”號災難,每年有數百萬噸石油汙染著世界海洋,造成生態災難。科學家們正在開發清理策略,並將在這些洩漏事件後蓬勃發展的微生物視為一種解決方案。現在, благодаря 對其中一種最有效的食油微生物的詳細解析,他們更接近於擁有針對此類環境災難的生物學補救措施。
Alcanivorax borkumensis 是一種桿狀細菌,它依靠石油來提供能量。在未受汙染的海洋中相對罕見,但在石油洩漏後迅速成為海洋微生物生態系統的主導者,並且遍佈世界各地的海洋。德國生物技術研究中心的維託·A. P. 馬丁斯·多斯·桑托斯和他的同事將這種海洋生物的基因組分解成超過 300 萬個鹼基對,然後將它們拼接成完整的基因圖譜。
該圖譜包含幾個所謂的“島嶼”,這些“島嶼”是 A. borkumensis 特有的,例如一組允許該生物分解石油中的烷烴並將其用作食物的基因。這種微生物還具有多種機制,可以利用碳氫化合物,使其相對於類似的生物具有競爭優勢。它的優勢還來自於它使用有機氮和無機氮的能力:“儘管原油中的許多成分是可生物降解的,但實際生物降解的主要限制是養分的可利用性,特別是氮和磷,”研究人員在《自然生物技術》雜誌上發表的關於該基因組的論文中解釋道。
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透過對這種食油微生物的基因組進行測序,科學家們希望利用其力量來幫助清理未來的石油洩漏。他們寫道:“基因組資料及其功能分析為我們提供了寶貴的知識庫,這對於設計、開發、測試和優化合理的策略以減輕石油洩漏對海洋系統造成的生態損害至關重要。”