儘管美國努力改變局勢，但蘇聯生物武器的威脅依然存在。康奈爾大學的凱瑟琳·沃格爾表示，俄羅斯和新獨立國家的研發和生產設施守衛薄弱，容易被盜。此外，俄羅斯繼續拒絕允許檢查其國防部下屬的四個生物武器設施。“我們沒有證據，但有人擔心俄羅斯限制訪問是為了保留其生物武器能力。我們希望有其他原因，”沃格爾報告說。
俄羅斯和新獨立國家的前生物武器專家已經收到了一些美國資金，用於將其研究轉向和平目的。但沃格爾在舊金山舉行的美國科學促進會年會上發言時指出，由於俄羅斯經濟不穩定，“你不能排除有人會因為誘惑或腐敗而從事擴散活動。”
科學家們尤其擔心天花病毒樣本可能被盜。天花病毒於1980年被根除，其唯一的官方儲存庫位於美國亞特蘭大疾病控制中心和俄羅斯科爾佐沃國家病毒學和生物技術研究中心。但俄羅斯的其他設施也可能儲存著這種病毒。其他令人擔憂的微生物包括基因工程改造的炭疽和鼠疫細菌菌株，它們對西方抗生素具有抗藥性，以及為攻擊農業目標而開發的動物病原體。
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沃格爾認為，最危險的威脅可能來自詭計多端的政府招募前生物武器科學家。“美國的防擴散計劃至關重要，”她斷言，“因為我們必須讓各國更難招募這些科學家並獲得他們先進的生物武器技術和專業知識。”